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如何计算 Python 中矩阵的 z 分数?

假设我有数组:

a = array([[   1,    2,    3],
           [  30,   35,   36],
           [2000, 6000, 8000]])

我想计算每一行的 z 分数。我想出的解决方案是:

array([zs(item) for item in a])

zs 在 scipy.stats.stats 中。有没有更好的内置矢量化方式来做到这一点?

此外,在使用具有欧几里得或苏几里得距离的层次聚类之前,z 分数总是好的吗?任何人都可以讨论相对的优点/缺点吗?

谢谢。

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scipy.stats.stats.zs 定义如下:

def zs(a):
    mu = mean(a,None)
    sigma = samplestd(a)
    return (array(a)-mu)/sigma

因此,要将其扩展为在 ndarray 的给定轴上工作,您可以这样做:

import numpy as np
import scipy.stats.stats as sss
def my_zs(a,axis=-1):
    b=np.array(a).swapaxes(axis,-1)    
    mu = np.mean(b,axis=-1)[...,np.newaxis]
    sigma = sss.samplestd(b,axis=-1)[...,np.newaxis]
    return (b-mu)/sigma


a = np.array([[   1,    2,    3],
           [  30,   35,   36],
           [2000, 6000, 8000]])    
result=np.array([sss.zs(item) for item in a])

my_result=my_zs(a)
print(my_result)
# [[-1.22474487  0.          1.22474487]
#  [-1.3970014   0.50800051  0.88900089]
#  [-1.33630621  0.26726124  1.06904497]]
assert(np.allclose(result,my_result))
于 2010-06-06T19:37:26.367 回答
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scipy 的新 zscore,在下一个版本中可用,采用任意数组维度

http://projects.scipy.org/scipy/changeset/6169

于 2010-06-07T20:26:25.873 回答