r - 如何在 Digital Micrograph 和 R 之间传输（连接）数据

Question

我是 DM 的新用户，我需要在Digital Micrograph和R之间传输数据（像素明亮） ，以处理和建模图像。

具体来说，我需要从原始图像中提取明亮的像素，将其发送到R进行处理，然后返回到 DM 以表示新图像。

我想知道这是否可能以及如何从 DM 中的脚本中做到这一点。

非常感谢。问候。

Answer 1

您可能还想尝试使用命令ScrapCopy()并将ScrapPasteNew()图像（或图像子区域）复制到剪贴板，但我不确定数据是如何在那里处理的。

Answer 2

DM（脚本）与外部世界之间几乎没有直接联系，因此最好的解决方案很可能是以下（以 DM 为中心的）路线：

在 DM 中启动一个脚本，该脚本执行以下操作：

• 所有需要的用户界面
• 提取强度等。
• 将所有需要的数据以合适的格式保存在特定路径的光盘上。（原始数据/文本数据/...）
• 调用外部应用程序（您可以从命令提示符调用的任何内容，包括 .bat 文件）并等待该命令完成

是否以可以从命令提示符调用的方式编写所有 R 代码，可能带有命令提示符参数（即配置文件）：

• 从特定路径读取数据
• 根据需要处理（没有 UI，所以“静默”进行）
• 将结果保存在特定路径的光盘上
• 关闭应用程序

此时，DM 中的脚本继续，读取结果（并可能对磁盘上的文件进行一些清理。）

---

因此，本质上，重要的是您的 R 代码可以作为完全由命令行参数控制的“独立”黑盒可执行文件工作。

启动外部应用程序所需的命令可以在“实用程序功能”下的帮助文档中找到，并且是LaunchExternalProcess. 它已在 GMS 2.3.1 中引入。