我正在使用 metaNMDS 来探索我正在使用的多元数据集。我已经通过一个有 6 个级别的感兴趣因素来限制数据集。排序是在布雷柯蒂斯相异矩阵上运行的，没有被自动转换，有 2 个维度（或轴），并且设置为最多运行 300 次迭代。椭圆基于 95% 的置信度并使用 SE。
NMDS 在大约 10-15 次迭代中求解，并且应力值差（15-18）还可以。当我用 ordiellipse 绘制数据以可视化哪些水平可能不同时，我惊讶于置信椭圆内实际上有多少数据。有人可以解释一下吗？这是否只是排序的产物，不能很好地拟合数据？没有捕获二维数据集中固有的变化？
有什么想法吗？我的声誉还不够高，无法发布情节图片，但如果我遇到一些问题，我可以发送一张。