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我有一堆 XML 文件和一个将它们的内容读入数据框的 R 脚本。但是，我现在得到了我想像往常一样解析的文件，但是它们的命名空间定义中有一些东西不允许我使用 XPath 表达式正常选择它们的值。

XML 文件是这样的：

xml_nons.xml

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<XML>
   <Node>
      <Name>Name 1</Name>
      <Title>Title 1</Title>
      <Date>2015</Date>
   </Node>
</XML>

和另一个：

xml_ns.xml

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<XML xmlns="http://www.nonexistingsite.com">
   <Node>
      <Name>Name 2</Name>
      <Title>Title 2</Title>
      <Date>2014</Date>
   </Node>
</XML>

xmlns 指向的 URL 不存在。

我使用的 R 代码是这样的：

library(XML)

xmlfiles <- list.files(path = ".", 
                       pattern="*.xml$", 
                       full.names = TRUE, 
                       recursive = TRUE)

n <- length(xmlfiles)
dat <- vector("list", n)

for(i in 1:n){
       doc <- xmlTreeParse(xmlfiles[i], useInternalNodes = TRUE)
       nodes <- getNodeSet(doc, "//XML")
       x <- lapply(nodes, function(x){ data.frame(
              Filename = xmlfiles[i],
              Name = xpathSApply(x, ".//Node/Name" , xmlValue),
              Title = xpathSApply(x, ".//Node/Title" , xmlValue),
              Date = xpathSApply(x, ".//Node/Date" , xmlValue)
            )})
            dat[[i]] <- do.call("rbind", x)
    }

    xml <- do.call("rbind", dat)
    xml

但是，我得到的结果是：

Filename            Name    Title    Date
./xml_nons.xml      Name 1  Title 1  2015

如果我从第二个文件中删除名称空间链接，我会得到正确的：

Filename            Name    Title    Date
./xml_nons_1.xml    Name 1  Title 1  2015
./xml_ns_1.xml      Name 2  Title 2  2014

当然，我可以有一个 XSL 来从原始 XML 文件中删除这些名称空间，但我想有一些在 R 中工作的解决方案。有没有办法告诉 R 只是忽略 XML 声明中的所有内容？

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1 回答 1

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我认为没有简单的方法可以忽略名称空间。最好的方法是学会和他们一起生活。这个答案将使用较新的 XML2 包。但同样适用于 XML 包解决方案。

利用

library(XML2)
fname='myfile.xml'
doc <- read_xml(fname)
#peak at the namespaces
xml_ns(doc)

第一个命名空间分配给 d1。如果 XPath 没有找到所需的内容，最可能的原因是名称空间问题。

xpath <-  "//d1:FormDef"
ns <- xml_find_all(doc,xpath, xml_ns(doc))
ns

此外，您必须为路径中的每个元素执行此操作所以为了节省输入，您可以执行

library(stringr)
> xpath <-  "/ODM/Study"
> (xpath<-str_replace_all(xpath,'/','/d1:'))
[1] "/d1:ODM/d1:Study"
于 2015-07-28T18:43:06.903 回答