python - 来自networkx中更大图的完全连接的子图

Question

我已经尝试不在这里转发，但我认为我的请求非常简单，我只是对网络图缺乏经验。在python中使用networkx模块时，我想从连接图中恢复所有节点相互连接的子图（节点数大于2）。有没有一种简单的方法可以做到这一点？

这是我的例子：

一个有七个节点的简单图。节点1、2、3是共享连接，节点1、2、4都是共享连接，节点5、6、7都是共享连接。

import networkx as nx
G=nx.Graph() #Make the graph
G.add_nodes_from([1,2,3,4,5,6,7]) #Add nodes, although redundant because of the line below
G.add_edges_from([(1,2),(1,3),(2,3),(1,4),(2,4),(1,5),(5,6),(5,7),(6,7)]) # Adding the edges

我想要的输出是： ([1,2,3],[1,2,4],[5,6,7])

我可以想到编写这个稍微费力的方法，但想知道是否有一个简单的内置函数。

Answer 1

听起来您想发现图表中的派系。为此，您可以使用nx.clique.find_cliques()：

>>> list(nx.clique.find_cliques(G))
[[1, 2, 3], [1, 2, 4], [1, 5], [6, 5, 7]]

nx.clique.find_cliques()返回一个生成器，它将产生图中的所有派系。您可以使用列表推导过滤掉少于三个节点的派系：

>>> [g for g in nx.clique.find_cliques(G) if len(g) > 2]
[[1, 2, 3], [1, 2, 4], [6, 5, 7]]