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我正在尝试为 C Cholmod库创建一个 Python 接口,它是SuiteSparse库 ( SuiteSparse ) 的一部分。

由于我是 Swig 的新手,我不知道这是否是一项艰巨的任务。我没有在 Swig 中找到对这个接口的任何引用。

编译没有问题。

这是我尝试导入 swig 生成的“_cholmod.py”文件时遇到的错误:

Python 2.7.5+ (default, Feb 27 2014, 19:37:08)
[GCC 4.8.1] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import _cholmod
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "_cholmod.py", line 99, in <module>
    class SuiteSparse_config_struct(_object):
  File "_cholmod.py", line 106, in SuiteSparse_config_struct
    __swig_setmethods__["malloc_func"] =
__cholmod.SuiteSparse_config_struct_malloc_func_set
NameError: name '_SuiteSparse_config_struct__cholmod' is not defined

这个名字是在哪里定义的? 在我尝试导入扩展之前,快速 grep 不会返回任何内容 ,但是我尝试导入它之后:

grep -R -n  _SuiteSparse_config_struct__cholmod *

Binary file _cholmod.pyc matches

我在用着:

  • SWIG 版本 3.0.5 使用 g++ [x86_64-unknown-linux-gnu] 编译配置选项:+pcre
  • SuiteSparse 4.4.3 中的 cholmod 库

这是一个最小的例子:

文件 setup.py:

from distutils.core import setup, Extension

module1 = Extension('__cholmod',
    sources=['cholmod.i'],
    libraries=['cholmod', 'suitesparseconfig', 'blas', 'amd'],
    library_dirs=['/home/nikolaj/Documents/WORK/Dominique/suitesparse
4.4.1-1_ArchLinux/suitesparse-4.4.1-1-x86_64.pkg/usr/lib/'],
    include_dirs=['/home/nikolaj/Documents/WORK/Dominique/suitesparse
4.4.1-1_ArchLinux/suitesparse-4.4.1-1-x86_64.pkg/usr/include/'],
    swig_opts=['-I/home/nikolaj/Documents/WORK/Dominique/suitesparse
4.4.1-1_ArchLinux/suitesparse-4.4.1-1-x86_64.pkg/usr/include/'])

setup(name='_cholmod', version='0.1', ext_modules=[module1])

我这样调用它:

python setup.py build_ext --inplace

文件 cholmod.i:

/* -*- C -*- */
#ifdef SWIGPYTHON

%module _cholmod

%{
#define SWIG_FILE_WITH_INIT
#include "SuiteSparse_config.h"

#include "cholmod_config.h"
#include "cholmod_core.h"
#include "numpy/arrayobject.h"
%}

%feature("autodoc", "1");

%init %{
    import_array();
%}

%include "SuiteSparse_config.h
%include "cholmod_config.h"
%include "cholmod_core.h"

#endif

我怀疑 typedef 和 C 结构存在问题,但在阅读了一遍又一遍教程、官方文档、演示文稿之后,我真的不知道我错过了什么。

有人可以在这里帮助我吗?非常感谢!

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