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我发现使用 Plotly 和 R,当我处理情节时,它们通常不能正确地从 R 转换为 Plotly。

例如,我在 R 中绘制的图表如下所示:

在此处输入图像描述

当我将它发送到 plotly 时,它看起来像这样:

在此处输入图像描述

(出于保密原因,一些数据已从两个图中隐藏)

我的代码如下所示:

plot <- ggplot(sytoxG_data_no_NC) +
  geom_ribbon(data = confidence_intervals_SG, mapping = aes(x = time_elapsed, ymin = phenotype_value.NC.lower, ymax = phenotype_value.NC.upper,
                                                            fill = "red", colour = NULL), alpha = 0.6) +
  scale_fill_manual(name = "Legend",
                    values = c('red'),
                    labels = c('Negative Control')) +
  xlab("Time Elapsed") +
  ylab("Sytox Green") +
  ggtitle("Sytox Green - Facets: Pathway") +
  facet_wrap(~Pathway, ncol=6, scales = "fixed") +
  theme(panel.grid = element_blank(),
        axis.ticks.length = unit(0, "cm"),
        panel.background = element_rect(fill = "white"),
        strip.text.x = element_text(size=4),
        axis.text = element_blank())
response <- py$ggplotly(plot, kwargs=list(world_readable=FALSE, filename="SG_sparklines_by_pathway", fileopt="overwrite"))
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2 回答 2

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问题很可能geom_ribbon出在方面而不是方面......您能否升级您的“情节”包并再试一次?

于 2015-05-08T21:26:27.757 回答
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我最终使用 facet_grid 而不是 facet_wrap。像这样的东西:

+ facet_grid(~Pathway, scales = "free", space="free")
于 2016-10-07T20:19:00.137 回答