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我正在尝试对一个包含大约十亿条记录(每条记录包含四个整数)的大文件进行排序。文件的大小将超过 50GB。

我正在用 4 亿条记录(大约 6 GB 文件)测试我的代码。我的磁盘配置如下所示:

disk=/var/tmp/stxxl,50G,syscall delete

我的机器有 16 GB RAM,有 8 个物理处理器(Intel i7),stxxl版本 1.4.1。如果我用 2 亿条记录运行代码,大约需要 5 分钟。但是当我运行包含 4 亿条记录的代码时,它似乎磁盘空间不足。我的问题是:

1) 为什么我的代码在排序 6 GB 文件时磁盘空间不足?请查看它(仅附上几条重要的行)。

2) 5 分钟是我的 PC 对 2 亿条记录进行排序的合理时间吗?如果是真的,我想知道 stxxl 是否可以在白天对 50 亿条记录进行排序。

3)你认为stxxl是解决这类问题的一个不错的选择吗?我也可以访问安装了 mpi 的集群。

代码(受示例/algo/sort_file.cpp 和示例/algo/phonebills.cpp 启发):

size_t memory_to_use = (1*1024) * 1024 * 1024ul;
typedef stxxl::vector<my_type, 1, stxxl::lru_pager<8>, block_size> vector_type;

std::copy(std::istream_iterator<my_type>(in),
  std::istream_iterator<my_type>(),
  std::back_inserter(v));

stxxl::sort(v.begin(), v.end(), Cmp(), memory_to_use);

每个向量元素或记录是四个无符号数字的元组:

struct my_type
{
  typedef unsigned short key_type;
  typedef std::tuple<key_type, key_type, key_type, key_type> key4tuple;
  ...
}
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如果您只想排序,请考虑使用 stxxl::sorter。

它应该只需要预期的磁盘空间量、数据的总大小,并且应该以至少 ~100 MB/s 的速度进行排序,具体取决于您的磁盘以及相对于数据类型大小的比较复杂程度。

stxxl::sort() 函数做更多的工作并且需要额外的空间,因为它会写入临时的额外数据。

另请参阅我的教程视频:)。

于 2015-01-14T22:21:55.050 回答