我正在尝试对一个包含大约十亿条记录(每条记录包含四个整数)的大文件进行排序。文件的大小将超过 50GB。
我正在用 4 亿条记录(大约 6 GB 文件)测试我的代码。我的磁盘配置如下所示:
disk=/var/tmp/stxxl,50G,syscall delete
我的机器有 16 GB RAM,有 8 个物理处理器(Intel i7),stxxl版本 1.4.1。如果我用 2 亿条记录运行代码,大约需要 5 分钟。但是当我运行包含 4 亿条记录的代码时,它似乎磁盘空间不足。我的问题是:
1) 为什么我的代码在排序 6 GB 文件时磁盘空间不足?请查看它(仅附上几条重要的行)。
2) 5 分钟是我的 PC 对 2 亿条记录进行排序的合理时间吗?如果是真的,我想知道 stxxl 是否可以在白天对 50 亿条记录进行排序。
3)你认为stxxl是解决这类问题的一个不错的选择吗?我也可以访问安装了 mpi 的集群。
代码(受示例/algo/sort_file.cpp 和示例/algo/phonebills.cpp 启发):
size_t memory_to_use = (1*1024) * 1024 * 1024ul;
typedef stxxl::vector<my_type, 1, stxxl::lru_pager<8>, block_size> vector_type;
std::copy(std::istream_iterator<my_type>(in),
std::istream_iterator<my_type>(),
std::back_inserter(v));
stxxl::sort(v.begin(), v.end(), Cmp(), memory_to_use);
每个向量元素或记录是四个无符号数字的元组:
struct my_type
{
typedef unsigned short key_type;
typedef std::tuple<key_type, key_type, key_type, key_type> key4tuple;
...
}