r - 从neo4j检索节点和关系到R控制台作为Dataframe

Question

我已经使用 neo4j 创建了图形数据库，我正在尝试从 R 中检索一些结果。但是相同的“GeneName”节点有许多连接，如附图所示（来自 Neo4J）。那么，是否可以在 R 控制台上将 GeneName 节点的所有连接作为数据框获取。

更详细的信息：

我从一个文件中获取的基因信息以及所附屏幕截图中 GeneName 节点周围的连接是从另一个文件中考虑的。我已经编写了 cypher 来根据所有文件中的通用基因名称连接各种文件。例如

文件 A（4 列和多行）

SCA1 信息1 信息2 信息3

文件 B（4 列和多行）

信息 5 信息 7 信息 8 信息 10 SCA1

现在我以基于 GeneName (SCA1) 的方式编写了一个密码查询，这两个文件是连接的

连接两个文件后的输出会像

SCA1 信息1 信息2 信息3 信息5 信息7 信息8 信息10

所以在截图中，每个 GeneName 节点都连接到 info1 info2 info3 info5 info7 info8 info10

Pavan Kumar Alluri 高级项目工程师 C-DAC KP 印度

![在此处输入图像描述][1]

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你可以尝试几件事：

ca1 = getSingleNode(graph, "MATCH (n:GeneName) WHERE n.name = 'CA1' RETURN n")
r = outgoingRels(ca1)

r然后是关系对象的列表。您可以在这些上使用 endNode 和 startNode。

lapply(r, startNode)
lapply(r, endNode)

或者：

r = getRels(graph, "MATCH (n:GeneName)-[r]->() WHERE n.name = 'CA1' RETURN r")

这还将获得一个关系对象列表，您可以在其上使用 apply 系列函数以及 endNode 和 startNode。

您还可以使用路径对象：

query = "
MATCH p = (n:GeneName)-->()
WHERE n.name = 'CA1'
RETURN p
"

p = getPaths(graph, query)
n = lapply(p, nodes)

当然，如果没有任何数据来重现您的图表，我无法确定哪种方法最好。我强烈建议通读文档和示例。

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