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我试图在 Anaconda 上安装 igraph 包，但到目前为止它没有用。如果有人想办法得到它，我会很乐意尝试的！！下面是我尝试做的一些细节（如果你有在 Anaconda 上安装 igraph 的解决方案，你不必阅读它！）。

我使用的是 MAC OS X Yosemite（MAC book Pro 2,3 GHz Intel Core i7）。以下是一些配置参数： MBP-de-Lecue:site-packages lecueguillaume$ which python /Users/lecueguillaume/anaconda/bin/python MBP-de-Lecue:site-packages lecueguillaume$ which pip /Users/lecueguillaume/anaconda/bin /点

igraph 应该通过 pip 安装。因为，当我输入 pip list 时，我可以在列表中看到包 igraph

python-igraph (0.7)

但是当我尝试在这里导入 igraph 时，我得到的是：

MBP-de-Lecue:site-packages lecueguillaume$ python Python 2.7.8 |Anaconda 2.1.0 (x86_64)| （默认，2014 年 8 月 21 日，15:21:46）[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5577)] 在 darwin

导入 igraph Traceback（最近一次调用最后）：文件“”，第 1 行，在文件“build/bdist.macosx-10.5-x86_64/egg/igraph/ init .py”，第 34 行，在

文件“build/bdist.macosx-10.5-x86_64/egg/igraph/_igraph.py”，第 7 行，在文件“build/bdist.macosx-10.5-x86_64/egg/igraph/_igraph.py”，第 6 行，在bootstrap ImportError：dlopen（/Users/lecueguillaume/.python-eggs/python_igraph-0.7-py2.7-macosx-10.5-x86_64.egg-tmp/igraph/_igraph.so，2）：未加载库：libxml2.2。 dylib 引用自：/Users/lecueguillaume/.python-eggs/python_igraph-0.7-py2.7-macosx-10.5-x86_64.egg-tmp/igraph/_igraph.so 原因：库版本不兼容：_igraph.so 需要 12.0 版本。 0 或更高版本，但 libxml2.2.dylib 提供版本 10.0.0

所以问题来自libxml2-2。我尝试使用 brew 升级 libxml：MBP-de-Lecue:site-packages lecueguillaume$ brew upgrade libxml2 Error: libxml2-2.9.2 already installed

1）我不明白的第一件事是libxml2.2版本12.0.0似乎不存在。http://xmlsoft.org上的最新版本是 9.2。那么为什么 igraph 要求版本 12.0 ？（我当然错过了一些东西）。

brew 没有帮助的事实是因为它没有更新正确的 libxml： MBP-de-Lecue:site-packages lecueguillaume$ which brew /usr/local/bin/brew

2) 我怎么能说 brew 来更新 anaconda/pkgs 中的 Anaconda libxml 库

3）我还尝试使用 conda pipbuild python-igraph 安装图形。一切顺利：成功安装了python-igraph 除了它必须自己安装igraph的C核心而我已经安装了它：安装收集的包：python-igraph运行setup.py install for python-igraph找不到C核心igraph 在这个系统上使用 pkg-config。我们现在将尝试从头开始下载和编译 C 内核。C核的版本号：0.7 我们也试试：0.7.0

所以看起来 conda 安装运行良好，但“导入 igraph”仍然不起作用。

4）最后，当我使用python的内置MAC版本时，igraph运行良好： MBP-de-Lecue:site-packages lecueguillaume$ which python2.7 /opt/local/bin/python2.7 MBP-de-Lecue :site-packages lecueguillaume$ python2.7 Python 2.7.8 (default, Jul 13 2014, 17:11:32) [GCC 4.2.1 Compatible Apple LLVM 5.1 (clang-503.0.40)] on darwin 输入“帮助”， “版权”、“学分”或“许可”以获取更多信息。

导入 igraph

所以 igraph 在 python 的 MAC 版本中安装得很好，但在 Anaconda 版本中没有。由于我使用 Anaconda Notebook（可与 Anaconda python 配合使用），因此我想在其上安装 igraph。

很抱歉这个问题很长（这是我第一次提出问题）。我对 graphviz 包也有同样的问题（安装在 MAC python2.7 版本上，但没有安装在 Anaconda python 版本上）。

非常感谢您的帮助！

纪尧姆。

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好的，这里有多个问题，所以我将尝试一一回答。

  1. 您看到的版本号与 libxml2 的“官方”版本号（顺便说一下，在撰写本文时是 2.9.2 而不是 9.2）无关。这是库的应用程序二进制接口 (ABI) 的版本号。一些项目选择使 ABI 的版本号与库的“公共”版本号保持同步，但这不是必需的。您可以使用 ; 检查 Mac 上库的 ABI 版本otool -L；例如，在我的 Mac 上otool -L /usr/lib/libxml2.2.dylib给我。current version 10.9.0

    现在，您的系统上似乎有多个副本libxml2。一个来自 OS X 本身，这是在/usr/lib. 另一个是从 brew 安装的 - 这是在/usr/local/lib. 也许还有第三个来自 Anaconda Python。问题是 igraph 在编译时链接到其中一个（使用 ABI 版本 12.0.0），但是当您尝试导入 igraph 时，系统找不到这个 libxml2 并尝试链接到另一个使用 ABI 版本 10.0 的文件.0 代替。由你来解决这个问题。首先，我会在您的机器上查找所有出现的libxml2*.dylib并运行otool -L在所有这些上查看哪个具有 ABI 版本 12.0.0 - 这是 igraph 链接到的那个。然后你可以尝试在编译和安装 igraph 时临时重命名这个库（以防止链接器找到它并链接到它），并在安装完成后重命名它。通过这种方式，您可以获得链接到 libxml2 的“正确”版本的 igraph 的编译版本。

  2. Brew 不会安装来自 Anaconda Python 的 libxml2，这是正确的 - 让一个软件（即 Brew）与另一个软件（即 Anaconda Python）的依赖关系混在一起通常是个坏主意。

  3. igraph 试图pkg-config在编译期间找到它的 C 内核；特别是，它执行pkg-config --cflags --libs igraph. 这对你有用吗？

于 2014-11-18T12:15:41.423 回答