我是多元统计的新手,所以如果这个问题很幼稚,或者我错过了一些重要的事情,请原谅我。
我想知道在使用 adonis 时如何处理不平衡的设计。我有一组河流沉积物中存在的微生物群落和因子流(4 个级别)、US_DS(2 个级别)和季节(2 个级别)(我还有其他因子,但暂时坚持这些)。例如下面的代码:
dist.L2<-vegdist(L2, mehod=”bray”)
adonis(dist.L2~Season*Stream*US_DS, data=factors, permutations=199)
不幸的是,设计是不平衡的(一些站点只有 1 个复制,而其他站点最多有 3 个)。
我尝试过运行 adonis,但是因为 anodis 使用 1 型 SS,所以我将因素放入的顺序会产生很大的不同,并且没有理由将一个因素放在其他因素之前。我知道其他统计数据包通过使用类型 II 或 III 的平方和来解决这个问题,并且无论您使用哪种类型的 SS,都有优点和缺点。我的数据的性质意味着其他更简单的统计测试并不适合。
我想知道如何将 III 型错误与 adonis 一起使用,或者是否有一个程序可以通过使用 I 型错误和 adonis 来找到合适的测试。谢谢