我有一个带有大列表的 .rda 文件，如下所示：
[[1]] Null
[[2]] Null
...
[[1000]] (Some data)
...
由于代码中的错误，创建了第一个K空行（示例中为 999），所以我决定删除所有1:K行。保存文件后，它的大小变大了：之前小于 1 GB，之后大于 16GB。怎么可能？如何解决？
我可以想象问题在于，在编辑列表之前它的值从 1 到N，而在编辑之后它只包含从K+1to的值N，但它有那么不同吗？如果这是问题，如何清除索引？
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我不能轻易复制这个，但我提供了这个模板：也许，正如上面的@RichardScriven 评论，你可以告诉我们你是如何删除这些NULL值的？
补资料：
set.seed(101)
z1 <- replicate(1000,runif(1000),simplify=FALSE)
z1[1:500] <- replicate(500,NULL)
保存并检查文件大小：
save("z1",file="tmp.rda")
file.size("tmp.rda")
## [1] 2666278
仅保留最后 500 个元素：
z2 <- z1[501:1000]
save("z2",file="tmp2.rda")
file.size("tmp2.rda")
## [1] 2666249
变得越来越小。
替换NULL为numeric(0)使结果稍微大一点。
z3 <- z1
z3[1:500] <- replicate(500,numeric(0))
save("z3",file="tmp3.rda")
file.size("tmp3.rda")
## [1] 2666290
于 2014-11-02T18:09:16.370 回答
2
删除 NULL 后，文件可能需要不同的压缩类型。它可能是未压缩的，然后在相同的压缩方案下重新压缩，尽管它应该不同，因为列表变小了很多倍。
从?save
...保存的文件可以在不同的压缩方案下解压缩和重新压缩（请参阅 resaveRdaFiles 以了解从 R 中执行此操作的方法）。
因此，当我在 Ben Bolker 的答案中运行resaveRdaFiles对象z2时，它会变小很多
file.info("tmp2.rda")[,1]
# [1] 2666373
tools::resaveRdaFiles("tmp2.rda")
file.info("tmp2.rda")[,1]
# [1] 2210736
于 2014-11-02T18:27:51.490 回答