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我有一个间隔列表,我需要返回与查询中传递的间隔重叠的那些。特殊之处在于,在典型查询中,大约三分之一甚至一半的间隔将与查询中给出的间隔重叠。此外,最短间隔与最长间隔的比例不超过 1:5。我实现了自己的区间树(增强的红黑树)——我不想使用现有的实现,因为我需要对闭区间和一些特殊功能的支持。我用 6000 个间隔的树中的 6000 个查询测试了查询速度(因此 n=6000 和 m=3000(应用程序))。事实证明,蛮力和使用树一样好:

Computation time - loop: 125.220461 s
Tree setup: 0.05064 s
Tree Queries: 123.167337 s

让我使用渐近分析。n:查询次数;n:间隔数;应用程序。n/2:查询中返回的间隔数:

时间复杂度蛮力:n*n

时间复杂度树:n*(log(n)+n/2) --> 1/2 n n + n log(n) --> n*n

所以结果是说对于大的n,两者应该大致相同。考虑到 n*n 前面的常数 1/2,仍然有人会以某种方式期望树明显更快。因此,对于我得到的结果,我可以想象三个可能的原因:

a)我的实施是错误的。(我应该像下面那样使用 BFS 吗?) b)我的实现是正确的,但是我让 Python 的事情变得很麻烦,所以它需要更多的时间来处理树而不是处理蛮力。c) 一切正常 - 这就是大型 n 的行为方式

我的查询函数如下所示:

from collections import deque

def query(self,low,high):
    result = []
    q = deque([self.root]) # this is the root node in the tree
    append_result = result.append
    append_q = q.append
    pop_left = q.popleft
    while q:
        node = pop_left() # look at the next node
        if node.overlap(low,high): # some overlap?
            append_result(node.interval)
        if node.low != None and low <= node.get_low_max(): # en-q left node
            append_q(node.low)                
        if node.high != None and node.get_high_min() <= high: # en-q right node
            append_q(node.high)

我像这样构建树:

def build(self, intervals):
    """
    Function which is recursively called to build the tree.
    """
    if intervals is None:
        return None

    if len(intervals) > 2: # intervals is always sorted in increasing order
        mid = len(intervals)//2
        # split intervals into three parts:
        # central element (median)
        center = intervals[mid]
        # left half (<= median)
        new_low = intervals[:mid]
        #right half (>= median)
        new_high = intervals[mid+1:]
        #compute max on the lower side (left):
        max_low = max([n.get_high() for n in new_low])
        #store min on the higher side (right):
        min_high = new_high[0].get_low()

    elif len(intervals) == 2:
        center = intervals[1]
        new_low = [intervals[0]]
        new_high = None
        max_low = intervals[0].get_high()
        min_high = None

    elif len(intervals) == 1:
        center = intervals[0]
        new_low = None
        new_high = None
        max_low = None
        min_high = None

    else:
        raise Exception('The tree is not behaving as it should...')

    return(Node(center, self.build(new_low),self.build(new_high),
                max_low, min_high))

编辑:

一个节点表示如下:

class Node:
    def __init__(self, interval, low, high, max_low, min_high):
        self.interval = interval # pointer to corresponding interval object
        self.low = low # pointer to node containing intervals to the left
        self.high = high # pointer to node containing intervals to the right
        self.max_low = max_low # maxiumum value on the left side
        self.min_high = min_high # minimum value on the right side

子树中的所有节点都可以这样获取:

def subtree(current):
    node_list = []
    if current.low != None:
        node_list += subtree(current.low)
    node_list += [current]
    if current.high != None:
        node_list += subtree(current.high)
    return node_list

ps 请注意,通过利用存在如此多的重叠并且所有间隔都有相当的长度,我设法实现了一种基于排序和二等分的简单方法,该方法在 80 秒内完成,但我会说这是过度拟合...... ,通过渐近分析,我发现它应该有app。与使用树相同的运行时...

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如果我正确理解了您的问题,那么您正在尝试加快您的流程。如果是这样,请尝试创建一棵真正的树而不是操纵列表。

看起来像:

class IntervalTreeNode():
    def __init__(self, parent, min, max):
        self.value      = (min,max)
        self.parent     = parent

        self.leftBranch = None
        self.rightBranch= None

    def insert(self, interval):
        ...

    def asList(self):
        """ return the list that is this node and all the subtree nodes """
        left=[]
        if (self.leftBranch != None):
            left = self.leftBranch.asList()
        right=[]
        if (self.rightBranch != None):
            left = self.rightBranch.asList()
        return [self.value] + left + right

然后在开始时创建一个 internalTreeNode 并插入你所有的间隔。这样,如果你真的需要一个列表,你可以在每次需要结果时构建一个列表,而不是每次你在递归迭代中使用[x:]or[:x]作为 list在 python 中,操作是一项代价高昂的操作。也可以直接使用节点而不是列表来工作,这将大大加快进程,因为您只需返回对节点的引用而不是进行一些列表添加。

于 2014-10-22T12:59:53.050 回答