multithreading - slurm中Matlab的物理与逻辑核心分配

Question

我是 slurm 集群上的用户，该集群被配置为考虑每个物理内核都有两个 CPU 进行分配。默认情况下，Matlab 每个物理内核最多生成一个线程，因为 Mathworks 已确定 Matlab 使用超线程没有任何好处。那么我是否适合为每个任务/parpool 工作程序请求两个 CPU，即使我只会生成一半的线程数？例如，如果我有一份需要 10 名工人的工作，我会说-c 20。

Answer 1

你可以这样做。但是如果你的集群配置正确，它应该知道每个核心有两个硬件线程，并且输出

$ sinfo -e -o "%N %z"

应该

nodename x:x:2

如果是这种情况，那么另一种方法是使用

--ntasks=10
--ntasks-per-core=1
--nnodes=1-1

这样，脚本更便携；它可以在其他集群上使用而无需更改。