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我正在尝试将多个密度图与叠加图结合起来。ggplot 和 geom_density 可以完成这项工作,但密度是相互叠加的。这是叠加的,但不是 3d

ggplot(all.complete, aes(x=humid_temp)) +  
  geom_density(aes(group=height, colour=height, fill=height.f, alpha=0.1)) + 
  guides(fill = guide_legend(override.aes = list(colour = NULL))) +
  labs(main="Temperature by Height", x="Temperature", y="Density")

与此类似的事情是我想要实现的: 密度? 带 3d 叠加

在我的情况下,岁月将被身高取代。

谢谢!!!

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3 回答 3

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您要查找的图表称为ridgelineplot。尝试使用ggridgesggplot2

一个带有时间数据的例子:

library(viridis)
ggplot(lincoln_weather, aes(x = `Mean Temperature [F]`, y = `Month`, fill = ..x..)) +
  geom_density_ridges_gradient(scale = 3, rel_min_height = 0.01, gradient_lwd = 1.) +
  scale_x_continuous(expand = c(0.01, 0)) +
  scale_y_discrete(expand = c(0.01, 0)) +
  scale_fill_viridis(name = "Temp. [F]", option = "C") +
  labs(title = 'Temperatures in Lincoln NE',
       subtitle = 'Mean temperatures (Fahrenheit) by month for 2016\nData: Original CSV from the Weather Underground') +
  theme_ridges(font_size = 13, grid = TRUE) + theme(axis.title.y = element_blank())

这是结果:

在此处输入图像描述

于 2018-04-02T20:58:02.293 回答
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我知道这个老了,但其他有这种问题的人可能会偶然发现这篇文章,所以我想我会添加一个最近发现的解决方案。刚刚创建了一个新包来执行这种类型的可视化,它被称为ggjoy并旨在与 ggplot2 系统一起使用。

所有信息都可以在这里找到:https ://github.com/clauswilke/ggjoy

希望这能有所帮助!

于 2017-07-17T19:39:52.997 回答
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正如@jlhoward 提到的,使用构面或使用子图可以工作,但是任何一个选项都不能很好地适应大量组。考虑改用 ecdf 图。

如果没有您的对象 all.complete 中的数据,我将无法重新创建您的绘图,所以这是一个简化的示例:

library(ggplot2)

ggplot(iris, aes(x = Sepal.Length)) +  
  geom_density(aes(group = Species, 
                   colour = Species, 
                   fill = Species),
               alpha = 0.2)

密度图

对于几个以上的组,我发现 ecdf 图更容易解释。制作类似的情节:

 ggplot(iris, aes(x = Sepal.Length)) +  
  stat_ecdf(aes(color = Species))

ecdf 图

您可以在同一个图上拥有数十个 ecdf 图,并且由于它们只是线条,因此它们仍然足够分开以供查看。如您的示例所示,密度图或直方图将过于重叠。

这是让我开始使用 ecdf 图并提供更多信息的博客文章:http: //allendowney.blogspot.com/2013/08/are-my-data-normal.html

于 2016-09-11T04:43:53.723 回答