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我想在 eHOF 包的 HOF 功能中考虑我的嵌套研究设计。我们采样了嵌套在样本块中的点和嵌套在村庄中的点（随机）。

到目前为止，我使用 GLMM 来描述栖息地类型（栖息地、解释性、固定）对物种丰富度（SpR、响应变量、固定）的影响。因此我使用了 lme (of nlme-package) 我可以将嵌套研究设计合并到函数中：

model1<-lme(SpR~Habitat,random=~1|Village/Block,data=birds) # full model

现在我想描述沿梯度对 SpR 的影响。我的 HOF 函数如下所示：

hof.blocks<-HOF(SpR,Indexc,M=max(SpR),bootstrap=100,
                 family=poisson)

有没有办法将嵌套研究设计纳入 HOF？

我也无法获得 P 值，也无法获得 F 或 R2 值。我忽略了什么吗？

包：eHOF 版本：1.4 R 版本 3.0.2

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1 回答 1

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No, not at the moment. You could try to fit the nonlinear models by hand using nlme(), perhaps looking in the eHOF package code for hints on how to specify the formula etc, but that package uses a non-linear optimiser directly, and not nlme() so you'll need to do the translation work to get a model formula that nlme can use and work out other details.

于 2014-09-10T19:57:27.987 回答