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我正在使用 matplotlib 绘制对数归一化图像,但我希望原始原始图像数据以颜色条而不是 [0-1] 间隔表示。我觉得通过使用某种归一化对象而不是事先转换数据,有一种更 matplotlib'y 的方式来做到这一点......无论如何,原始图像中可能存在负值。

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

def log_transform(im):
    '''returns log(image) scaled to the interval [0,1]'''
    try:
        (min, max) = (im[im > 0].min(), im.max())
        if (max > min) and (max > 0):
            return (np.log(im.clip(min, max)) - np.log(min)) / (np.log(max) - np.log(min))
    except:
        pass
    return im

a = np.ones((100,100))
for i in range(100): a[i] = i
f = plt.figure()
ax = f.add_subplot(111)
res = ax.imshow(log_transform(a))
# the colorbar drawn shows [0-1], but I want to see [0-99]
cb = f.colorbar(res)

我尝试过使用 cb.set_array,但它似乎没有做任何事情,而 cb.set_clim 则完全重新调整了颜色。

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就在这里!使用LogNorm. 这是我编写的实用程序的代码摘录,用于在对数刻度上显示混淆矩阵。

from pylab import figure, cm
from matplotlib.colors import LogNorm

# C = some matrix
f = figure(figsize=(6.2, 5.6))
ax = f.add_axes([0.17, 0.02, 0.72, 0.79])
axcolor = f.add_axes([0.90, 0.02, 0.03, 0.79])

im = ax.matshow(C, cmap=cm.gray_r, norm=LogNorm(vmin=0.01, vmax=1))

t = [0.01, 0.1, 0.2, 0.4, 0.6, 0.8, 1.0]
f.colorbar(im, cax=axcolor, ticks=t, format="$%.2f$")

f.show()
于 2010-03-30T15:52:12.300 回答
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如果您只想对图像进行对数归一化(以增强细节),而不是数据(以保留物理值),那么您必须对颜色图本身应用转换。您可以使用说明书中给出的函数 cmap_map() 来做到这一点: https ://scipy-cookbook.readthedocs.io/items/Matplotlib_ColormapTransformations.html

于 2011-08-31T20:04:29.083 回答