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我正在使用带有 Intel Xeon 处理器和 24 GB RAM 的 64 位 Windows Server 2008 机器。我在尝试读取 11 GB（>2400 万行，20 列）的特定 TSV（制表符分隔）文件时遇到问题。我通常的伙伴，，read.table让我失望了。我目前正在尝试ff通过以下程序打包：

> df <- read.delim.ffdf(file       = "data.tsv",
+                       header     = TRUE,
+                       VERBOSE    = TRUE,
+                       first.rows = 1e3,
+                       next.rows  = 1e6,
+                       na.strings = c("", NA),
+                       colClasses = c("NUMERO_PROCESSO" = "factor"))

这适用于大约 600 万条记录，但随后出现错误，如您所见：

read.table.ffdf 1..1000 (1000) csv-read=0.14sec ffdf-write=0.2sec
read.table.ffdf 1001..1001000 (1000000) csv-read=240.92sec ffdf-write=67.32sec
read.table.ffdf 1001001..2001000 (1000000) csv-read=179.15sec ffdf-write=94.13sec
read.table.ffdf 2001001..3001000 (1000000) csv-read=792.36sec ffdf-write=68.89sec
read.table.ffdf 3001001..4001000 (1000000) csv-read=192.57sec ffdf-write=83.26sec
read.table.ffdf 4001001..5001000 (1000000) csv-read=187.23sec ffdf-write=78.45sec
read.table.ffdf 5001001..6001000 (1000000) csv-read=193.91sec ffdf-write=94.01sec
read.table.ffdf 6001001..
Error in scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings,  : 
  could not allocate memory (2048 Mb) in C function 'R_AllocStringBuffer'

如果我没记错的话，R 抱怨缺乏内存来读取数据，但是在读取数据read...ffdf时，程序不应该避免大量内存使用吗？我在这里做错了什么？

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（我意识到这是一个老问题，但我遇到了同样的问题并花了两天时间寻找解决方案。这似乎是记录我最终为后代找到的东西的好地方。）

问题不在于您的可用内存不足。问题是您已经达到了单个字符串的内存限制。从帮助（'内存限制'​​）：

对单个对象也有限制。存储空间不能超过地址限制，如果您尝试超过该限制，错误消息开始无法分配长度向量。一个字符串的字节数限制为 2^31 - 1 ~ 2*10^9，这也是数组每个维度的限制。

在我的情况下（它也出现在你的情况下）我没有费心设置引号字符，因为我正在处理制表符分隔的数据并且我认为这并不重要。但是，在数据集中间的某个地方，我有一个带有不匹配引号的字符串，然后 read.table 愉快地跑到了行尾，一直到下一个，下一个，下一个......直到它达到了字符串大小的限制并爆炸了。

quote = ""解决方案是在参数列表中显式设置。

于 2017-03-16T18:35:52.380 回答