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我需要对我以 FASTA 格式下载的 DNA 序列(核苷酸)序列执行 K 均值聚类和层次聚类。所以在执行聚类之前,我需要对基数(a,t,c,g)进行十进制编码。那么如何做到这一点..这样我就可以在 MATLAB 中以矩阵形式获取这个输入?
使用 nt2int 函数。下面的文档:
http://www.mathworks.com/help/bioinfo/ref/nt2int.html