在尝试合并多个数据框时,我得到了一些非常奇怪的东西。帮助!
我需要通过“RID”和“VISCODE”列合并一堆数据框。这是它的外观示例:
d1 = data.frame(ID = sample(9, 1:100), RID = c(2, 5, 7, 9, 12),
VISCODE = rep('bl', 5),
value1 = rep(16, 5))
d2 = data.frame(ID = sample(9, 1:100), RID = c(2, 2, 2, 5, 5, 5, 7, 7, 7),
VISCODE = rep(c('bl', 'm06', 'm12'), 3),
value2 = rep(100, 9))
d3 = data.frame(ID = sample(9, 1:100), RID = c(2, 2, 2, 5, 5, 5, 9,9,9),
VISCODE = rep(c('bl', 'm06', 'm12'), 3),
value3 = rep("a", 9),
values3.5 = rep("c", 9))
d4 = data.frame(ID =sample(8, 1:100), RID = c(2, 2, 5, 5, 5, 7, 7, 7, 9),
VISCODE = c(c('bl', 'm12'), rep(c('bl', 'm06', 'm12'), 2), 'bl'),
value4 = rep("b", 9))
dataList = list(d1, d2, d3, d4)
我查看了题为“使用循环将几个 data.frames 合并到一个 data.frame中”的问题的答案。我使用了那里建议的reduce方法以及我写的一个循环:
try1 = mymerge(dataList)
try2 <- Reduce(function(x, y) merge(x, y, all= TRUE,
by=c("RID", "VISCODE")), dataList, accumulate=F)
其中 dataList 是数据帧列表,而 mymerge 是:
mymerge = function(dataList){
L = length(dataList)
mdat = dataList[[1]]
for(i in 2:L){
mdat = merge(mdat, dataList[[i]], by.x = c("RID", "VISCODE"),
by.y = c("RID", "VISCODE"), all = TRUE)
}
mdat
}
对于我的测试数据和真实数据的子集,它们都可以正常工作并产生完全相同的结果。但是,当我使用较大的数据子集时,它们都会分解并给我以下错误: match.names(clabs, names(xi)) 中的错误:名称与以前的名称不匹配。
真正奇怪的是,使用它可以:
dataList = list(demog[1:50,],
neurobat[1:50,],
apoe[1:50,],
mmse[1:50,],
faq[1:47, ])
并且使用它失败了:
dataList = list(demog[1:50,],
neurobat[1:50,],
apoe[1:50,],
mmse[1:50,],
faq[1:48, ])
据我所知,faq 的第 48 行没有什么特别之处。同样,使用这个作品:
dataList = list(demog[1:50,],
neurobat[1:50,],
apoe[1:50,],
mmse[1:50,],
pdx[1:47, ])
并且使用它失败了:
dataList = list(demog[1:50,],
neurobat[1:50,],
apoe[1:50,],
mmse[1:50,],
pdx[1:48, ])
faq 中的第 48 行和 pdx 中的第 48 行具有相同的 RID 和 VISCODE 值,相同的 EXAMDATE 值(我不匹配的东西)和不同的 ID 值(另一个我不匹配的东西)。除了匹配的 RID 和 VISCODE 之外,我还看到了它们的特别之处。它们不共享任何其他变量名称。同样的情况发生在数据的其他地方,没有问题。
要为复杂功能锦上添花,这甚至行不通:
dataList = list(demog[1:50,],
neurobat[1:50,],
apoe[1:50,],
mmse[1:50,],
faq[1:48, 2:3])
其中第 2 列和第 3 列是“RID”和“VISCODE”。
48 甚至不是神奇的数字,因为它有效:
dataList = list(demog[1:500,],
neurobat[1:500,],
apoe[1:500,],
mmse[1:457,])
使用 mmse[1:458, ] 失败。
我似乎无法提出导致问题的测试数据。以前有人遇到过这个问题吗?关于如何合并的任何更好的想法?