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对于在顶部元素定义了显式命名空间的 XML 文档,我正在努力获得 XPath 表达式和命名空间规范的正确组合,这是 package XML(argument namespaces)所要求的。xmlns

更新

感谢 har07 我能够把它放在一起:

查询命名空间后,第一个条目ns还没有名称,这就是问题所在:

nsDefs <- xmlNamespaceDefinitions(doc)
ns <- structure(sapply(nsDefs, function(x) x$uri), names = names(nsDefs))

> ns
                                             omegahat                          r 
    "http://something.org"  "http://www.omegahat.org" "http://www.r-project.org" 

所以我们只需分配一个名称作为前缀(这可以是任何有效的 R 名称):

names(ns)[1] <- "xmlns"

现在我们要做的就是在我们的 XPath 表达式中到处使用默认的命名空间前缀:

getNodeSet(doc, "/xmlns:doc//xmlns:b[@omegahat:status='foo']", ns)

对于那些对基于name()namespace-uri()(以及其他)的替代解决方案感兴趣的人可能会发现这篇文章很有帮助。


仅供参考:这是我们找到解决方案之前的试错代码:

考虑以下示例?xmlParse

require("XML")

doc <- xmlParse(system.file("exampleData", "tagnames.xml", package = "XML"))

> doc
<?xml version="1.0"?>
<doc>
  <!-- A comment -->
  <a xmlns:omegahat="http://www.omegahat.org" xmlns:r="http://www.r-project.org">
    <b>
      <c>
        <b/>
      </c>
    </b>
    <b omegahat:status="foo">
      <r:d>
        <a status="xyz"/>
        <a/>
        <a status="1"/>
      </r:d>
    </b>
  </a>
</doc>
nsDefs <- xmlNamespaceDefinitions(getNodeSet(doc, "/doc/a")[[1]])
ns <- structure(sapply(nsDefs, function(x) x$uri), names = names(nsDefs))
getNodeSet(doc, "/doc//b[@omegahat:status='foo']", ns)[[1]]

然而,在我的文档中,命名空间已经在<doc>标记中定义,因此我相应地修改了示例 XML 代码:

xml_source <- c(
  "<?xml version=\"1.0\"?>",
  "<doc xmlns:omegahat=\"http://www.omegahat.org\" xmlns:r=\"http://www.r-project.org\">",
  "<!-- A comment -->",
  "<a>",
  "<b>",
  "<c>",
  "<b/>",
  "</c>",
  "</b>",
  "<b omegahat:status=\"foo\">",
  "<r:d>",
  "<a status=\"xyz\"/>",
  "<a/>",
  "<a status=\"1\"/>",
  "</r:d>",
  "</b>",
  "</a>",
  "</doc>"
)
write(xml_source, file="exampleData_2.xml")  
doc <- xmlParse("exampleData_2.xml")
nsDefs <- xmlNamespaceDefinitions(doc)
ns <- structure(sapply(nsDefs, function(x) x$uri), names = names(nsDefs))    
getNodeSet(doc, "/doc", namespaces = ns)
getNodeSet(doc, "/doc//b[@omegahat:status='foo']", namespaces = ns)[[1]]  

一切仍然正常。不过,更重要的是,我的 XML 代码还明确定义了默认命名空间 ( xmlns):

xml_source <- c(
  "<?xml version=\"1.0\"?>",
  "<doc xmlns=\"http://something.org\" xmlns:omegahat=\"http://www.omegahat.org\" xmlns:r=\"http://www.r-project.org\">",
  "<!-- A comment -->",
  "<a>",
  "<b>",
  "<c>",
  "<b/>",
  "</c>",
  "</b>",
  "<b omegahat:status=\"foo\">",
  "<r:d>",
  "<a status=\"xyz\"/>",
  "<a/>",
  "<a status=\"1\"/>",
  "</r:d>",
  "</b>",
  "</a>",
  "</doc>"  
)
write(xml_source, file="exampleData_3.xml")  
doc <- xmlParse("exampleData_3.xml")
nsDefs <- xmlNamespaceDefinitions(doc)
ns <- structure(sapply(nsDefs, function(x) x$uri), names = names(nsDefs))

过去的工作现在失败了:

> getNodeSet(doc, "/doc", namespaces = ns)
list()
attr(,"class")
[1] "XMLNodeSet"
Warning message:
using http://something.org as prefix for default namespace http://something.org 

> getNodeSet(doc, "/xmlns:doc", namespaces = ns)
XPath error : Undefined namespace prefix
XPath error : Invalid expression
Error in xpathApply.XMLInternalDocument(doc, path, fun, ..., namespaces = namespaces,  : 
  error evaluating xpath expression /xmlns:doc
In addition: Warning message:
using http://something.org as prefix for default namespace http://something.org 
getNodeSet(doc, "/xmlns:doc", 
  namespaces = matchNamespaces(doc, namespaces="xmlns", nsDefs = nsDefs)
)

这似乎让我更接近:

> getNodeSet(doc, "/xmlns:doc",
+ namespaces = matchNamespaces(doc, namespaces="xmlns", nsDefs = nsDefs)
+ )[[1]]
<doc xmlns="http://something.org" xmlns:omegahat="http://www.omegahat.org" xmlns:r="http://www.r-project.org">
  <!-- A comment -->
  <a>
    <b>
      <c>
        <b/>
      </c>
    </b>
    <b omegahat:status="foo">
      <r:d>
        <a status="xyz"/>
        <a/>
        <a status="1"/>
      </r:d>
    </b>
  </a>
</doc> 

attr(,"class")
[1] "XMLNodeSet"

然而,现在我不知道如何进行才能到达子节点:

> getNodeSet(doc, "/xmlns:doc//b[@omegahat:status='foo']", ns)[[1]]
XPath error : Undefined namespace prefix
XPath error : Invalid expression
Error in xpathApply.XMLInternalDocument(doc, path, fun, ..., namespaces = namespaces,  : 
  error evaluating xpath expression /xmlns:doc//b[@omegahat:status='foo']
In addition: Warning message:
using http://something.org as prefix for default namespace http://something.org 

> getNodeSet(doc, "/xmlns:doc//b[@omegahat:status='foo']",
+ namespaces = c(
+ matchNamespaces(doc, namespaces="xmlns", nsDefs = nsDefs),
+ matchNamespaces(doc, namespaces="omegahat", nsDefs = nsDefs)
+ )
+ )
list()
attr(,"class")
[1] "XMLNodeSet"
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3 回答 3

3

没有前缀 ( xmlns="...") 的命名空间定义是默认命名空间。如果 XML 文档具有默认命名空间,则在上述默认命名空间中考虑声明默认命名空间的元素及其所有没有前缀且没有不同默认命名空间声明的后代。

因此,在您的情况下,您需要在 XPath 中所有元素的开头使用为默认命名空间注册的前缀,例如:

/xmlns:doc//xmlns:b[@omegahat:status='foo']

更新 :

实际上我不是 的用户r,但是在网上查看一些参考资料可能会起作用:

getNodeSet(doc, "/ns:doc//ns:b[@omegahat:status='foo']", c(ns="http://something.org"))
于 2014-07-25T11:46:11.980 回答
1

我认为@HansHarhoff 提供了一个非常好的解决方案。

对于仍在寻找解决方案的其他人,根据我的经验,我认为以下方法更普遍,因为单个 XML 文档可以有多个命名空间。

doc <- xmlInternalTreeParse(xml_source)

ns <- getDefaultNamespace(doc)[[1]]$uri
names(ns)[1] <- "xmlns"

getNodeSet(doc, "//xmlns:Parameter", namespaces = ns)
于 2017-08-31T16:31:39.170 回答
0

我有一个类似的问题,但就我而言,我并不关心命名空间,并且想要一个忽略命名空间的解决方案。

假设我们在变量 myxml 中有以下 XML:

<root xmlns="uri:someuri.com:schema">
<Parameter>Test
</Parameter>
</root>

在 R 中,我们想阅读这个,所以我们运行:

myxml <- '
<root xmlns="uri:someuri.com:schema">
  <Parameter>Test
</Parameter>
</root>
'
myxmltop <- xmlParse(myxml)
ns <- xmlNamespaceDefinitions(myxmltop, simplify =  TRUE)

在这里,我使用 simple=TRUE 参数简化了 Rappster 的代码。现在我们可以像 Rappster 的代码一样添加命名空间的名称/前缀:

names(ns)[1] <- "xmlns"

现在我们可以通过以下方式引用这个命名空间:

getNodeSet(myxmltop, "//xmlns:Parameter", namespaces =ns)

更简单的解决方案(忽略命名空间)

我们还可以通过以下方式匹配任何命名空间来更加灵活:

myxmltop <- xmlParse(myxml)
getNodeSet(myxmltop, "//*[local-name() = 'Parameter']")

这个解决方案的灵感来自这个 SO answer

于 2016-07-27T12:50:42.760 回答