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我观察到 kernlab 使用 rbfkernel 作为,

rbf(x,y) = exp(-sigma * euclideanNorm(x-y)^2)

但是根据这个wiki链接,rbf内核应该是这样的

rbf(x,y) = exp(-euclideanNorm(x-y)^2/(2*sigma^2))

这也更直观,因为两个具有较大核 sigma 值的紧密样本将导致更高的相似度匹配。

我不确定是什么e1071 svm用途(本机代码 libsvm?)

我希望有人能告诉我为什么会有区别?我发现了这一点,因为我最初使用e1071但切换到ksvm但看到两者的结果不一致。一个比较小的例子

set.seed(123)
x <- rnorm(3)
y <- rnorm(3)
sigma <- 100

rbf <- rbfdot(sigma=sigma)
rbf(x, y)
exp( -sum((x-y)^2)/(2*sigma^2) )

我希望内核值接近 1(因为 x,y 来自 sigma=1,而内核 sigma=100)。这仅在第二种情况下观察到。

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我也遇到了这种差异,我最终深入研究了源代码,以确定文档中是否存在拼写错误,或者由于高斯上下文中的 sigma 传统上作为分母中的标准差而发生了什么,对吧?

这是相关来源

**kernlab\R\kernels.R**
## Define the kernel objects,
## functions with an additional slot for the kernel parameter list.
## kernel functions take two vector arguments and return a scalar (dot product)


rbfdot<- function(sigma=1)
  {

    rval <- function(x,y=NULL)
    {
      if(!is(x,"vector")) stop("x must be a vector")
      if(!is(y,"vector")&&!is.null(y)) stop("y must a vector")
      if (is(x,"vector") && is.null(y)){
        return(1)
      }
      if (is(x,"vector") && is(y,"vector")){
        if (!length(x)==length(y))
          stop("number of dimension must be the same on both data points")
        return(exp(sigma*(2*crossprod(x,y) - crossprod(x) - crossprod(y))))  
        # sigma/2 or sigma ??
      }
    }
     return(new("rbfkernel",.Data=rval,kpar=list(sigma=sigma)))
  }

您可以从他们的评论中观察到sigma/2 or sigma ??,他们可能对采用的约定有点困惑,存在/2将与标准偏差形式一致/(2*sigma),但我不得不推测这一发现。

现在,另一个确凿的证据在帮助页面中,? rbfdot其中显示...

sigma 高斯、拉普拉斯、贝塞尔和方差分析核使用的逆核宽度

这与他们在分子中使用 sigma 的形式是一致的,因为在分母中,它将与高斯右的宽度成比例地缩放。所以看起来他们确实采用了维基百科文章中描述为伽马形式的约定,他们说

等效但更简单的定义涉及参数 gamma = -1/(2*sigma^2)

因此,差异似乎只是采用不同但等效的约定。特定约定的一个动机(有人可能会在评论中确认)可能来自代码重用和一致性问题,正如您所见,该参数被其他三种内核形式使用,它们的参数可能更传统地设置在分子中。但是,我不确定这一点,因为我从未使用过那些备用内核并且对每个内核都不熟悉。

于 2015-01-21T18:39:31.053 回答