bash - 用于成对比较的 Bash 脚本

Question

我想编写一个 bash 脚本来对我的文件进行成对计算。

我在目录中有一个固定文件和一系列文件，我想将它们用于成对比较。

例如：

固定文件的名称是：Genome.vcf 成对计算的文件名都在一个目录中：ind_GER、ind_ENG、ind_MRO

我想出了以下脚本：

#!/bin/bash

for pop1 in $(find ind_*)
do
for pop2 in $(find ind_*)
do

 vcftools --gzvcf PATH/Genome.vcf --weir-fst-pop $pop1 --weir-fst-pop $pop2 --out $pop1_$pop2_fst

done
done

我得到的错误是：

Error: Requested Missing Argument

显然，我弄错了，如果您能提供帮助，我将不胜感激，谢谢。

Answer 1

改变这个：

--out $pop1_$pop2_fst

为了：

--out ${pop1}_${pop2}_fst

_是变量名中的有效字符。