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我读过关于 kd-trees 的文章,但是当空间的维度很高时它们效率低下。我有一个值数据库,我想找到查询的某个汉明距离内的值。例如,数据库是一个 32 位数字的列表,我想找到与查询值相差小于 3 位的所有数字。

我在某处听说过 MultiVariate Partition 树,但找不到好的参考。我知道 min-Hash 给出了一个很好的近似值,更好,但我想要一个准确的答案。

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汉明距离与levenshtein distance密切相关,类似于用于拼写校正的算法。

一种有效的方法是trie中的分支定界搜索。它需要的时间在距离上是指数的,对于近距离,直到字典大小是线性的。

如果字典是存储在二进制树中的二进制词,具有严格的汉明距离,这里是一个简单的伪代码:

walk(trie, word, i, hit, budget){
  if (budget < 0 || i > word.length) return;
  if (trie==NULL){
    if (i==word.length) print hit;
    return;
  }
  hit[i] = 0;
  walk(trie.subtrie[0], word, i+1, hit, (word[i]==0 ? budget : budget-1));
  hit[i] = 1;
  walk(trie.subtrie[1], word, i+1, hit, (word[i]==1 ? budget : budget-1));
}

main(){
  for (int budget = 0; ; budget++){
    walk(trie, word, 0, hit, budget);
    /* quit if enough hits have been printed */
  }
}

这个想法是你遍历整个 trie,跟踪当前 trie 节点和原始单词之间的距离。您可以通过预算可以容忍多少距离来修剪搜索。这是有效的,因为随着您深入树丛,距离永远不会减少。

然后您重复执行此操作,预算从零开始并逐步增加,直到您打印出您想要的命中。由于每次步行所覆盖的节点比随后的步行要少得多,因此进行多次步行并没有什么坏处。如果k是固定的,您可以简单地将其作为您的预算。

于 2010-03-06T13:57:25.937 回答