dynamic - 以社区结构传播动态

Question

我有一个数据集，希望通过社区结构来模拟传播动态。我遵循的步骤是

1. 使用 Networkx 将数据导入复杂网络
2. 将网络划分为一些称为社区的模块
3. 模拟 SIS 模型并绘制有和没有社区的图。

在第 2 步和第 3 步之间有些东西让我感到困惑。分区后，我得到了一些包含节点编号的社区。社区编号和节点编号是第 3 步的唯一输入，我如何模拟有和没有社区的 SIS？

Answer 1

我在您原始帖子的评论中回答您的最后一个问题。它对应于 2 个不同的任务：1）人工生成一些网络（有或没有社区结构）和 2）应用 SIS。

在 Networkx 中，有许多生成模型，列在此页面上。但是我看不到任何模型来生成社区结构的网络。您可以使用Lancichinetti 的 C++ 程序，它实现了一个非常广泛的模型。

关于 SIS 的应用，您可以考虑Netpidemix，它使用 Networkx 作为过程的网络部分。或者，igraph库还包含生成模型和流行病相关模型（例如SIR）