cluster-analysis - 如何查看 ELKI DBSCAN 聚类结果

Question

我正在使用 ELKI 对大约 14,000 个 GPS 点进行 DBSCAN 聚类。它运行良好，但我想查看有关集群的信息，例如集群中有多少点。？

Answer 1

如果您使用-resulthandler ResultWriterand 输出到文本，则簇大小将位于每个簇文件的顶部。

可视化工具目前似乎没有显示集群大小。

Answer 2

如果您使用 -resulthandler ResultWriter 并输出到文本，则集群大小将位于每个集群文件的顶部。

此外，如果您想将所有这些结果合并到一个文件中，这里有一个可以工作的 python 脚本：

clusterout_path = "path/to/where/files/all/go/"
finalout_path = "/path/for/single/merged/file/"
consol_filename= "single_merged_file.txt"

cll_file = open(finalout_path + consol_filename,"a")
cll_file.write("ClusterID"+ "\t" + "Lon" + "\t" + "Lat" + "\n")
def readFile(file):
    f = open(clusterout_path + file)
    counter = 0
    cluster = ""
    lon = ""
    lat = ""
    for line in f.readlines():
        counter+=1
        if counter == 1:
            cluster = line.split(":")[1].strip().lower()

        if counter > 4 and line.startswith("ID"):
            arr = line.split(" ")
            lon = arr[1]
            lat = arr[2]
            cll_file.write(cluster + "\t" + lon + "\t" + lat + "\n") 
    f.close()

listing = os.listdir(clusterout_path)
for infile in listing:
    print "Processing file: " + infile
    readFile(infile) 

cll_file.close()