scripting - PBS 编程

Question

关于 PBS 的一些简短且可能很愚蠢的问题：

1-我使用

qsub job_file

是否可以在作业文件中提交（子）作业？

2-我有以下脚本：

qsub job_a
qsub job_b

对于启动 job_b，最好在 job_a 的结果完成之前拥有。是否可以设置某种障碍或其他解决方法，以便在 job_a 完成之前不会启动 job_b？

谢谢

score 2 · Accepted Answer

回答第一个问题：

通常，您只能从运行 PBS 服务器的主机提交作业，但这取决于您的 PBS 系统的设置方式。

回答第二个问题：

您可以使用依赖项。阅读 qsub 文档中的 -W 选项。这是一个示例 bash 脚本：

dependency_id=$(qsub job_a)
qsub -W depend=afterok:$dependency_id job_b

job_b 将在 job_a 成功完成后启动。

score 1 · Accepted Answer

是的，可以从另一个工作提交工作，尽管它有一些警告。

- 你的妈妈必须在路径中有客户端命令（qsub）

-$USECP 将尝试从运行第一个作业的节点复制文件。

- 小心从其他作业提交作业，因为如果您的提交脚本调用了太多 qsubs，您很容易使 pbs_server 崩溃。

您可以使用以下语法让作业 b - z 依赖于作业“a”

qsub foo.sh -W 依赖=afterok:jobA

作业数组也可能是一个很好的解决方案。

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