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嗨，我遇到了 cran 的 rJava 包的问题。

我已经安装

sudo apt-get install openjdk-7-jdk
sudo apt-get install r-cran-rjava

跑了

sudo R CMD javareconf
# Java interpreter : /usr/bin/java
# Java version     : 1.7.0_55
# Java home path   : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre
# Java compiler    : /usr/bin/javac
# Java headers gen.: /usr/bin/javah
# Java archive tool: /usr/bin/jar

然后我尝试运行 R 并加载 rJava 并得到以下错误：

R
> library(rJava)
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/usr/lib/R/site-library/rJava/libs/rJava.so':
  libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory
Error: package or namespace load failed for ‘rJava’

我在 Ubuntu 14.04 64 位并且正在使用 R 版本 3.1.0 (2014-04-10)——“春舞”

更新：实际上这不是特定于 OpenJDK，我只是尝试了 oracle java 8 并得到了相同的结果。我也在这里发现了这个我不愿意使用的解决方法，因为它确实是一种解决方法，并没有真正解释为什么它是必要的。在我看来，包装系统应该已经处理了这个问题。似乎 libjvm.so 是问题所在，我把它放在这里

/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/jamvm/libjvm.so
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so
/usr/lib/jvm/java-7-oracle/jre/lib/amd64/server/libjvm.so

并且由于某种原因，尽管使用 sudo R CMD javareconf 进行了更新，rJava 还是找不到它们。

更新 2：情节变厚：如果我将 R 作为 sudo 运行，它可以工作。

感谢指点。

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6 回答 6

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您可以通过在超级用户中打开 rstudio 来解决这个问题

sudo rstudio

然后在 R 里面运行

install.packages('rJava')
于 2015-03-09T06:36:58.460 回答
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我在类似的配置（R 3.1.0、Ubuntu 12.10、32 位）上遇到了同样的问题。我发现答案是正确设置 LD_LIBRARY_PATH，如下所述： 错误：无法加载已安装的软件包，只是有问题的子目录是“客户端”而不是“服务器”。所以现在我设置我的环境是这样的：

export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386
export LD_LIBRARY_PATH=$JAVA_HOME/jre/lib/i386:$JAVA_HOME/jre/lib/i386/client
于 2014-05-10T23:16:27.563 回答
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我能够使用这个答案永久解决这个问题：https ://stackoverflow.com/a/25932828/3939832

如果您安装了 Oracle java 7 或 8，这将非常有用。在我的情况下，导出变量并不是一个永久的解决方案。您应该通过以下方式检查 R 用作环境的内容：

Sys.getenv("JAVA_HOME")

然后您可以通过创建上述答案链接中所述的java.conf文件来使用该环境。on /etc/ld.so.conf.d/

于 2014-10-11T16:17:17.427 回答
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如果您使用的是 oracle java，请使用以下命令：

sudo R CMD javareconf

不会帮助使用：

sudo R CMD javareconf **JAVA_HOME**=(path where java home is located)
于 2015-07-09T11:46:55.523 回答
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我尝试了很多东西，但没有奏效。然后我尝试使用

sudo rstudio

进而

install.packages('rJava')

它的工作。酷

于 2016-01-12T09:11:48.540 回答
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在 Ubuntu 上安装 rJava 包并不像大多数其他 R 包那么简单。关于如何做的一些快速说明（来源：https ://www.r-bloggers.com/installing-rjava-on-ubuntu/ ）。

Install the Java Runtime Environment (JRE).

sudo apt-get install -y default-jre

Install the Java Development Kit (JDK).

sudo apt-get install -y default-jdk

Update where R expects to find various Java files.

sudo R CMD javareconf

Install the package.

> install.packages("rJava")

If you have a RStudio session open, then exit and restart it. This is important (a running RStudio session will not pick up these changes!).
于 2018-10-12T13:26:47.477 回答