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我正在使用 Java 中的并行性来实现一种有效的序列比对算法。我想返回序列的所有可能位置。

你们能建议一个可行的算法吗？我已经研究过 Needem-Wunsch 和 Smith-Waterman，但我正在寻找一些不太复杂但仍然有效的东西。我刚刚开始使用并行性，所以它不能太复杂。

谢谢。

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您可以将 BLAST 用于基本局部对齐搜索工具

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于 2014-05-01T23:19:53.870 回答