python - 在 h5py 数据集中添加或删除特定的行或列

Question

创建h5py 数据集后，如何从 NxM 数组中添加或删除特定的行或列？

我的问题与此类似，但我不想盲目地截断或扩展数组。删除时，我需要能够指定要删除的确切行或列。

对于添加，我知道我必须maxshape=(None, None)在创建初始数据集时指定，但该resize方法似乎不允许您指定在缩小大小时会截断哪些行或列。

Answer 1

h5py 并不是真正为此而设计的。Pandas可能是一个更好的库，因为它是围绕表格的概念构建的。

话虽如此，以下是如何做到这一点：

In [1]: f = h5py.File('test.h5')

In [2]: arr = rand(4,4)

In [3]: dset = f.create_dataset('foo',data=arr,maxshape=(2000,2000))

In [4]: dset[:]
Out[4]:
array([[ 0.29732874,  0.59310285,  0.61116263,  0.79950116],
       [ 0.4194363 ,  0.4691813 ,  0.95648712,  0.56120731],
       [ 0.76868585,  0.07556214,  0.39854704,  0.73415885],
       [ 0.0919063 ,  0.0420656 ,  0.35082375,  0.62565894]])

In [5]: dset[1:-1,:] = dset[2:,:]

In [6]: dset.resize((3,4))

In [7]: dset[:]
Out[7]:
array([[ 0.29732874,  0.59310285,  0.61116263,  0.79950116],
       [ 0.76868585,  0.07556214,  0.39854704,  0.73415885],
       [ 0.0919063 ,  0.0420656 ,  0.35082375,  0.62565894]])

这会从 中删除第 1 列dset。它通过将第 2 列和第 3 列分别分配给 1 和 2 来实现，然后将数据集缩小一列。交换下标以删除第 1 行。如果您要经常这样做，您可以轻松地为此编写一个包装器。