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我正在使用箱线图和条形图基于几个分类变量(因子、x 变量)绘制连续数据(y 变量)。为此,默认绘图函数提供了一个方便的基于公式的界面,我可以在其中输入数据:响应 ~ 因子 1 + 因子 2 + ... 并获得因子 1、因子 2 等的组合作为 x 轴坐标。

但是,我正在努力找出这些原始坐标值对于我的数据是什么,因为我想在我的图中注释一些值。

例子:

data(iris)
iris[,"DummyFactor"] <- as.factor(c("First", "Second"))
boxplot(Sepal.Length ~ Species + DummyFactor, data = iris)
stripchart(Sepal.Length ~ Species + DummyFactor, data = iris, vertical=T, add=T, pch=16)

# y-axis values:
ys <- iris[,"Sepal.Length"]
# x-axis:
# How to obtain the x-axis values on my current plot?

通过实验我发现这个例子中的 x 值是:

xs <- apply(model.matrix(~ -1 + Species + DummyFactor, data = iris), MARGIN=1, FUN=function(x) sum(c(1,2,3,3)[as.logical(x)]))
# Annotate a few examples, e.g. 7th, 100th and 120th observation
points(x=xs[c(7,100,120)], y=ys[c(7,100,120)], pch=16, col="red", cex=2)
iris[c(7,100,120),]
#> iris[c(7,100,120),]
#    Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width    Species DummyFactor
#7            4.6         3.4          1.4         0.3     setosa       First
#100          5.7         2.8          4.1         1.3 versicolor      Second
#120          6.0         2.2          5.0         1.5  virginica      Second

...这可行,但似乎不是解决此问题的正确方法。似乎箱线图和条形图的公式实现对用户是隐藏的。

箱线图/条形图示例

在一般情况下,是否有一种简单的方法来获取这些坐标?

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1 回答 1

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请参阅以下at参数?boxplot
“给出箱线图绘制位置的数值向量,[...];默认为 1:n,其中 n 是箱数。”

您可以从例如对象中的names插槽中获取框的数量boxplot(请参阅以下中的“值” ?boxplot

bp <- boxplot(Sepal.Length ~ Species + DummyFactor, data = iris)
bp
bp$names

这些框是有序的,因此绘图公式(物种)中第一个因子的水平变化最快,然后是第二个(虚拟因子)。获取框数:

length(bp$names)

创建一个默认 x ( at) 坐标的向量:

at <- seq_along(bp$names)

相同的值可以通过以下方式获得:

at <- with(iris, seq_along(levels(interaction(Species, DummyFactor))))

从 Species 和 DummyFactor 之间的交互中创建一个因子。这将用于子集“at”:

intr <- with(iris, interaction(Species, DummyFactor))

将 x 坐标添加到数据框:

iris$at <- at[intr]

加分:

points(Sepal.Length ~ at, data = iris[c(7, 100, 120), ], pch = 16, col = "red", cex = 2)
于 2014-04-17T17:17:13.540 回答