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我有一个 opendap thredds 链接到一个目录,该目录包含来自特拉华州业务预报系统 (DBOFS) 的许多海洋模型输出文件。历史数据存储在单独的每小时文件中,甚至一些文件跨越多个小时。我想看这些文件,就好像它们是一个长时间的系列一样。我在这里遇到了另一个类似的问题:循环通过 netcdf 文件并运行计算 - Python 或 R

使用通配符搜索返回以下错误:

import netCDF4

f = netCDF4.MFDataset('http://opendap.co-ops.nos.noaa.gov/thredds/dodsC/NOAA/DBOFS/MODELS/201401/nos.dbofs.fields.n001.20140130.*.nc')
---------------------------------------------------------------------------
ValueError                                Traceback (most recent call last)
<ipython-input-3-a44e21cddbe9> in <module>()
----> 1 f = netCDF4.MFDataset('http://opendap.co-ops.nos.noaa.gov/thredds/dodsC/NOAA/DBOFS/MODELS/201401/nos.dbofs.fields.n001.20140130.*.nc')

C:\Users\cenglert\AppData\Local\Enthought\Canopy32\User\lib\site-packages\netCDF4.pyd in netCDF4.MFDataset.__init__ (netCDF4.c:6458)()

ValueError: cannot using file globbing for remote (OPeNDAP) datasets
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就像错误所说的那样,您不能*在远程数据集上使用通配符(用于通配符),但您可以构建数据集 URL 的 python 列表并将它们传递给MFDataset. 像这样:

import netCDF4

base = 'http://opendap.co-ops.nos.noaa.gov/thredds/dodsC/\
NOAA/DBOFS/MODELS/201401/nos.dbofs.fields.n001.20140130.t%2.2dz.nc'
files = [base % d for d in range(0,24,6)]
nc = netCDF4.MFDataset(files)
print nc.variables['salt']

产生:

<class 'netCDF4._Variable'>
float64 salt('ocean_time', 's_rho', 'eta_rho', 'xi_rho')
    long_name: salinity
    time: ocean_time
    coordinates: lat_rho lon_rho
    field: salinity, scalar, series
unlimited dimensions = ('ocean_time',)
current size = (4, 10, 732, 119)

并显示实际上,0、6、12 和 18 小时的四个值实际上已由MFDataset.

于 2014-04-16T18:38:46.957 回答