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我正在查询 Freebase 以获取大约 10000 部电影的类型信息。

在阅读了如何在 R 中使用 getURL() 优化抓取后,我尝试并行执行请求。然而,我失败了——见下文。除了并行化,我还读到这httr可能是RCurl.

我的问题是:是否可以通过使用以下循环的并行版本(使用 WINDOWS 机器)来加速 API 调用?GETb) getURL的替代品,例如httr-package?

library(RCurl)
library(jsonlite)
library(foreach)
library(doSNOW)

df <- data.frame(film=c("Terminator", "Die Hard", "Philadelphia", "A Perfect World", "The Parade", "ParaNorman", "Passengers", "Pink Cadillac", "Pleasantville", "Police Academy", "The Polar Express", "Platoon"), genre=NA)

f_query_freebase <- function(film.title){

  request <- paste0("https://www.googleapis.com/freebase/v1/search?",
                    "filter=", paste0("(all alias{full}:", "\"", film.title, "\"", " type:\"/film/film\")"),
                    "&indent=TRUE",
                    "&limit=1",
                    "&output=(/film/film/genre)")

  temp <- getURL(URLencode(request), ssl.verifypeer = FALSE)
  data <- fromJSON(temp, simplifyVector=FALSE)
  genre <- paste(sapply(data$result[[1]]$output$`/film/film/genre`[[1]], function(x){as.character(x$name)}), collapse=" | ")
  return(genre)
}


# Non-parallel version
# ----------------------------------

for (i in df$film){
  df$genre[which(df$film==i)] <- f_query_freebase(i)      
}


# Parallel version - Does not work
# ----------------------------------

# Set up parallel computing
cl<-makeCluster(2) 
registerDoSNOW(cl)

foreach(i=df$film) %dopar% {
  df$genre[which(df$film==i)] <- f_query_freebase(i)     
}

stopCluster(cl)

# --> I get the following error:  "Error in { : task 1 failed", further saying that it cannot find the function "getURL". 
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1 回答 1

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这不会单个 R 会话中实现并行请求,但是,它是我用来在多个R 会话中实现 >1 个同时请求(例如并行)的东西,因此它可能很有用。

在高水平

您需要将该过程分成几个部分:

  1. 获取您需要进行的 URL/API 调用列表并将其存储为 csv/文本文件
  2. 使用下面的代码作为启动多个 R 进程并在它们之间划分工作的模板

注意:这恰好在 Windows 上运行,所以我使用了 powershell。在 mac 上,这可以用 bash 编写。

Powershell/bash 脚本

使用单个 powershell 脚本启动多个实例 R 进程(这里我们将工作分配给 3 个进程):

例如,保存一个带有.ps1文件扩展名的纯文本文件,您可以双击它来运行它,或者使用任务调度程序/cron 来安排它:

start powershell { cd C:\Users\Administrator\Desktop; Rscript extract.R 1; TIMEOUT 20000 }
start powershell { cd C:\Users\Administrator\Desktop; Rscript extract.R 2; TIMEOUT 20000 }
start powershell { cd C:\Users\Administrator\Desktop; Rscript extract.R 3; TIMEOUT 20000 }

它在做什么?它会:

  • 转到桌面,启动它找到的名为 的脚本extract.R,并为 R 脚本提供一个参数(123)。

R进程

每个 R 进程可以看起来像这样

# Get command line argument 
arguments <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)
process_number <- as.numeric(arguments[1])

api_calls <- read.csv("api_calls.csv")

# work out which API calls each R script should make (e.g. 
indicies <- seq(process_number, nrow(api_calls), 3)

api_calls_for_this_process_only <- api_calls[indicies, ] # this subsets for 1/3 of the API calls
# (the other two processes will take care of the remaining calls)

# Now, make API calls as usual using rvest/jsonlite or whatever you use for that
于 2021-02-19T17:54:58.213 回答