对于我的系统：Ubuntu 12.04和R 3.03，每当我通过R 在R中安装自定义包时
>install.packages()
该软件包默认安装到
/home/USER/R/x86_64-pc-linus-gnu-library/3.0/
而不是系统范围的
/usr/local/lib/R/site-library/
Shiny-server需要使用该软件包。
我的临时解决方案是事后将包复制到正确的文件夹中。
问题：如何从一开始就设置默认安装路径以避免此问题？
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是的——我认为这是一个错误功能并禁用了我的每个用户目录。
此外，我主要使用一个脚本install.r（其中一个版本是您可以作为 Ubuntu 的一部分安装的较小软件包中的一个示例），它简单地将目录明确设置/usr/local/lib/R/site-library为默认目录。通过我们进入 R 3.0.2 或 3.0.3 的补丁，普通用户可以写入目录，现在将创建组可写目录，以便其他用户可以更新和覆盖——只要让每个人都成为同一组的成员，比如说staff或admin。然后你甚至不需要sudo或root。
多年来，我基本上已经在这里多次回答过同样的问题（减去闪亮的角度，这并不真正相关），所以请随时搜索其他问题以获取更多详细信息、示例、...
于 2014-03-28T03:45:00.053 回答
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我会提出一种不同的方法。
问题是 shiny-server 找不到您安装的软件包，因为它以不同的用户身份运行它们，称为shiny. 该用户是在安装闪亮服务器时创建的
解决此问题的最简单（也是最安全的恕我直言）方法是使用以下步骤以闪亮用户身份安装软件包。
- 使用 为用户设置密码
sudo passwd shiny，现在输入并确认您选择的密码。 - 使用以下命令切换到闪亮帐户：
su - shiny - 调用
R使用$ R（不带 sudo） - 安装所需的包，在这种情况下：`install.packages("shinydashboard")
请注意，如果您在同一台机器上安装了 rstudio-server，那么您可以使用该界面执行步骤 2-4。只需转到相同的域/IP 并使用 :8787 作为 rstudio-server 接口，而不是使用 :3838 作为闪亮服务器。
改编自我在这里的回答
于 2015-10-07T15:46:25.087 回答