r - CCA输出问题

Question

所以帮助将不胜感激！

我已经完成了一个 CCA 图，其中显示了 7 个地点、大约 15 个物种和 6 个环境变量。但是，它是说不受约束的轴为 0，我无法对我的 CCA 结果完成方差分析，以了解轴的重要性。我还尝试使用该spenvcor函数来查看环境与物种的相关性，它给我的所有轴都是 1。

所以我肯定做错了什么，但我就是不知道是什么。这是我的代码：

MayEnviro <- read.csv("MayEnviro.csv", header=TRUE)
MaySpecies <- read.csv("MaySpecies.csv", header=TRUE)
t <- cca(MaySpecies,
         MayEnviro[, c("AFDM","Chla","Chloride","TSS","TN","TP","Velocity")])
spenvcor(t)   

Answer 1

您可以从具有n = 7 个站点、m = 15 个物种的数据集中得出的轴数为min(n, m) - 1，即 6。由于您还有 6 个约束（环境变量），因此您可以准确地解释数据并且没有剩余方差一起工作。事实上，解决方案没有任何限制，结果就像 CA。

在这种情况下，由于站点如此之少，您应该寻找具有较少约束的模型，例如最多 2 或 3 个。