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我无法理解 glmer 与泊松模型和 difflsmeans 之间结果的一些差异。这两个函数都来自 lmerTest 包。基本上,glmer 告诉我这两个系数在 p < 0.05 时很重要,但是当我使用 difflsmeans 时,它会给出不同的结果。我正在使用泊松链接和偏移量来模拟计数数据,并包括治疗的固定效应和批次实验的随机效应。

在其他使用高斯链接的分析中,lmer 和 difflsmeans 都给出了相同的结果。

将 difflsmeans 用于具有泊松链接的混合模型是否有效?

还有其他方法可以检查系数的重要性吗?(我知道这已经被问过,但我的意思是在这个分析的背景下)

提前致谢

来自 GLMER 的结果

Generalized linear mixed model fit by maximum likelihood ['glmerMod']
Family: poisson ( log )
Formula: EventType1ObjectCount ~ offset(log(ValidObjectCoun)) + Treatment +      (1 | Plate) 
Data: data.m2 

  AIC       BIC    logLik  deviance 
 3050.641  3061.986 -1521.321  3042.641 

Random effects:
Groups Name        Variance Std.Dev.
Plate  (Intercept) 0.787    0.8871  
Number of obs: 126, groups: Plate, 5

Fixed effects:
            Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)    
(Intercept) -0.93879    0.39800  -2.359  0.01834 *  
TreatmentB  -0.26771    0.01961 -13.650  < 2e-16 ***
TreatmentD  -0.06326    0.01937  -3.266  0.00109 ** 

来自差异的结果意味着

Differences of LSMEANS:
                 Estimate Standard Error     DF t-value Lower CI Upper CI p-value
Treatment F-B    3e-01       2.23e-01  3e+06    1.20   -0.170    0.706     0.2
Treatment F-D    1e-01       2.14e-01  3e+06    0.30   -0.357    0.483     0.8
Treatment B-D   -2e-01       2.22e-01  3e+06   -0.92   -0.640    0.231     0.4
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2 回答 2

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lmerTest 包应该只适用于 lmer 对象,因此在 glmer 对象上使用 difflsmeans 是无效的。感谢您指出这一点-当然,将 difflsmeans 应用于 lmer 对象以外的对象时会出现错误..

于 2014-03-07T14:34:22.857 回答
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你问:使用泊松(日志)链接是否有效。我认为一个简单的“否”是正确的答案。我认为它只是被忽视了。

显着性检验要求您指定一个假设。我还没有看到一个。

于 2014-03-07T14:51:38.273 回答