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我目前正在在scikit-learn没有 root 访问权限的计算机上安装 Python 包。在 Fedora 14 上使用 Python 2.7。

pip 没有安装，所以我使用的是easy_install：

easy_install --prefix=$HOME/.local -U scikit-learn

安装过程抱怨没有安装 BLAS。我过去曾尝试安装 scipy，但在查找和安装 Atlas/BLAS 时遇到了麻烦。从那以后，我检查了 numpy 对 Atlas 没有问题：

>>> import numpy as np
>>> np.__config__.show()
atlas_threads_info:
    libraries = ['lapack', 'ptf77blas', 'ptcblas', 'atlas']
    library_dirs = ['/usr/lib/atlas']
    language = f77
    include_dirs = ['/usr/include']

blas_opt_info:
    libraries = ['ptf77blas', 'ptcblas', 'atlas']
    library_dirs = ['/usr/lib/atlas']
    define_macros = [('ATLAS_INFO', '"\\"3.8.3\\""')]
    language = c
    include_dirs = ['/usr/include']

atlas_blas_threads_info:
    libraries = ['ptf77blas', 'ptcblas', 'atlas']
    library_dirs = ['/usr/lib/atlas']
    language = c
    include_dirs = ['/usr/include']

lapack_opt_info:
    libraries = ['lapack', 'ptf77blas', 'ptcblas', 'atlas']
    library_dirs = ['/usr/lib/atlas']
    define_macros = [('ATLAS_INFO', '"\\"3.8.3\\""')]
    language = f77
    include_dirs = ['/usr/include']

lapack_mkl_info:
  NOT AVAILABLE

blas_mkl_info:
  NOT AVAILABLE

mkl_info:
  NOT AVAILABLE

/usr/lib/atlas存在，并且包含 .so 文件。

这是easy_install存在的错误：

error: Setup script exited with error: Command "gcc -pthread -fno-strict-aliasing -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -m32 -march=i686 -mtune=atom -fasynchronous-unwind-tables -D_GNU_SOURCE -fPIC -fwrapv -DNDEBUG -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -m32 -march=i686 -mtune=atom -fasynchronous-unwind-tables -D_GNU_SOURCE -fPIC -fwrapv -fPIC -I/usr/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/include -I/usr/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/include -I/usr/include/python2.7 -c sklearn/__check_build/_check_build.c -o build/temp.linux-i686-2.7/sklearn/__check_build/_check_build.o" failed with exit status 1
/usr/lib/python2.7/site-packages/numpy/distutils/misc_util.py:248: RuntimeWarning: Parent module 'numpy.distutils' not found while handling absolute import
  from numpy.distutils import log

以及安装早期的警告：

/usr/lib/python2.7/site-packages/numpy/distutils/system_info.py:1392: UserWarning:
    Atlas (http://math-atlas.sourceforge.net/) libraries not found.
    Directories to search for the libraries can be specified in the
    numpy/distutils/site.cfg file (section [atlas]) or by setting
    the ATLAS environment variable.

所以安装过程似乎找不到 numpy 或 Atlas。我如何告诉它在哪里可以找到这些？

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3 回答 3

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如果您没有 root 访问权限并且想要安装自己的模块 virtualenv 是要走的路。

要设置一个默认环境，只需执行以下操作：

$ pip install virtualenv
$ virtualenv ~/.default_env

# Add the activate script to the bashrc

$ echo "source ~/.default_env/bin/activate

在此之后，您可以使用 pip 或 easy_install 安装您想要的任何软件包。

于 2014-10-31T05:12:16.043 回答
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从源代码安装 numpy 和 scipy 有时会很棘手。如果你想要一个简单的出路，我建议安装一个科学的 Python 发行版，它将安装一个包含所有必要库的单独的 Python。那里有几个选项，我推荐来自 continuum.io 的 anaconda，你可以在这里下载。

于 2014-11-02T17:33:13.410 回答
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我宁愿在评论中问这个问题，但没有足够的声誉这样做：

export ATLAS=/usr/lib/atlas/libatlas.so之前有easy_install帮助吗？

于 2014-04-01T09:34:52.330 回答