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如果有人能指导我解决以下错误消息，我将不胜感激：

f = h5py.File(filename, 'w', driver='mpio', comm=comm)
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/h5py/_hl/files.py", line 149, in __init__
fapl = make_fapl(driver,libver,**kwds)
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/h5py/_hl/files.py", line 37, in make_fapl
raise ValueError('Unknown driver type "%s"' % driver)
ValueError: Unknown driver type "mpio"

我使用 ubuntu 软件中心安装了 h5py。（我运行 h5cc -showconfig 并注意到并行 HDF5 已启用。）

我在带有 core 2 duo 的 macbook air 上运行，只为 ubuntu 13.04 的虚拟桌面启用了一个内核。

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Ubuntu 附带的 h5py 版本不是针对并行 HDF5 构建的。这就是为什么您不能使用 MPI 驱动程序的原因。您需要手动构建 h5py。最方便的方法是使用virtualenv环境，这样并行的h5py版本就不会干扰Ubuntu安装的版本。你所要做的就是：

  1. 从 h5py.org 解压 h5py 源代码
  2. 确保你在一个 virtualenv 中（或者不要，如果你喜欢全局安装 h5py。但是你最好在 Ubuntu 中卸载 h5py）
  3. $ 出口 CC=mpicc
  4. $ python setup.py build --mpi
  5. $ python setup.py 安装

而已。有关详细信息，请参阅http://docs.h5py.org/en/latest/mpi.html。

于 2014-03-31T15:57:18.160 回答