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我正在使用带有 numpy.i 的 SWIG 向 python 公开一个 C 库。我试图包装的函数需要一系列double数组作为参数:

int wcsp2s(struct wcsprm *wcs, int ncoord, int nelem, const double pixcrd[], double imgcrd[], double phi[], double theta[], double world[], int stat[]);

其中一些数组实际上是二维的,其范围由ncoordandnelem参数给出。我遇到问题的是这些二维数组,因为numpy.i似乎只支持 , 或各种排列形式的东西int n1int n2double * arr的 C 函数不想要那些额外的整数),或者double arr[ANY][ANY]. 后者看起来很有希望,因为多维 C 数组只是一个连续的内存块,因此应该与函数所期望的兼容。但是当我尝试

%apply (double INPLACE_ARRAY2[ANY][ANY]) {(double imgcrd[]),(double world[])};

SWIG(或者更确切地说是在 SWIG 的输出上运行的 gcc)抱怨:

wcs_wrap.c:3770:7: error: expected expression before ‘,’ token

这里 SWIG 为这些参数生成了无效的 C 代码。

我在这里尝试做的事情可能吗?我想我可以使用 %inplace 和 %rename 来创建一个包装函数,该函数确实接受数组的(不必要的)维度,然后调用真正的函数。如果我可以将这些数组作为输出参数返回(它们的尺寸很容易基于ncoordnelem.

或者也许已经存在到 libwcs 的快速(即不是 astLib 中的那个)python 接口,所以我不必这样做?

编辑:我刚刚发现了pywcs(它的名字很明显,我应该在我最初的搜索中找到它),它解决了我的潜在问题。

Edit2:我猜一个包装器接收一个 2d numpy 数组 ans 传递一个扁平视图会解决这个问题,因为 1d 数组似乎可以工作。尽管如此,对于一个简单的包装器(.i、_wrap.c、来自 swig 的 .py 和一个额外的 .py 来进一步包装 SWIG 函数以解决维度问题),最终还是需要大量文件。

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我还缺少一本很好的使用食谱numpy.i。据我了解,您可以:

  • 传递动态大小的数组,您也可以将维度作为函数参数传递。如果您的函数表现不同,请编写一个包装器(例如,IN_ARRAY2INPLACE_ARRAY2)。
  • 传递固定大小的数组(例如,IN_ARRAY2INPLACE_ARRAY2)。
  • 当返回数组(例如,ARGOUT_ARRAY1)时,您必须在从 python 调用它时传递大小。在下面的示例中,您将编写oo = func3(20). 原因似乎是因为python需要分配内存,它需要知道大小,

例如,您的.i-file 可能看起来像他的:

...
%include "numpy.i"

%init %{
  import_array();
%}

// Pass  array of dynamic size:
%apply (double* INPLACE_ARRAY2, int DIM1, int DIM2) {(double *xx, int xx_n, int xx_m)};
void func1(double *xx,int xx_n, int xx_m);

// Pass array of fixed size:
%apply (int *INPLACE_ARRAY2[ANY][ANY]) { (double yy[4][4]) };
void func2(double yy[4][4]);

// Return a dynamic 1D array:
%apply (double* ARGOUT_ARRAY1, int DIM1) {(double* out, int out_n)}
void func3(double* out, int out_n);

当然,您可以结合使用这些 - 查看文档以获取更多信息

于 2014-02-22T01:24:03.017 回答