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我有 2 个 CSV 文件。

首先,我想取 1 列并列出一个列表。

然后我想从另一个 CSV 创建一个字典,但只包含一个列中的值与之前创建的列表中已经存在的值匹配的行。

这是到目前为止的代码:

#modified from: http://bit.ly/1iOS7Gu
import pandas
colnames = ['Gene > DB identifier', 'Gene_Symbol',  'Gene > Organism > Name', 'Gene > Homologues > Homologue > DB identifier',  'Homo_Symbol',  'Gene > Homologues > Homologue > Organism > Name',  'Gene > Homologues > Data', 'Sets > Name']
data = pandas.read_csv(raw_input("Enter csv file (including path)"), names=colnames)

filter = set(data.Homo_Symbol.values)

print set(data.Homo_Symbol.values)

#new_dict = raw_input("Enter Dictionary Name")
#source: http://bit.ly/1iOS0e3
import csv
new_dict = {}
with open('C:\Users\Chris\Desktop\gwascatalog.csv', 'rb') as f:
  reader = csv.reader(f)
  for row in reader:
      if row[0] in filter:
        if row[0] in new_dict:
            new_dict[row[0]].append(row[1:])
        else:
            new_dict[row[0]] = [row[1:]]
print new_dict

以下是 2 个示例数据文件:http ://bit.ly/1hlpyTH

有任何想法吗?提前致谢。

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1 回答 1

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您可以使用collections.defaultdict摆脱对 dict 中列表的检查:

from collections import defaultdict

new_dict = defaultdict(list)
#...
   for row in reader:
      if row[0] in filter:
         new_dict[row[0]].append(row[1:])
于 2014-02-15T18:01:23.257 回答