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问题已从原文编辑

在阅读了这个有趣的讨论之后,我想知道如何使用 dplyr 替换列中的 NA,例如,Lahman 击球数据:

Source: local data frame [96,600 x 3]
Groups: teamID

   yearID teamID G_batting
1    2004    SFN        11
2    2006    CHN        43
3    2007    CHA         2
4    2008    BOS         5
5    2009    SEA         3
6    2010    SEA         4
7    2012    NYA        NA

以下不符合我的预期

library(dplyr)
library(Lahman)

df <- Batting[ c("yearID", "teamID", "G_batting") ]
df <- group_by(df, teamID )
df$G_batting[is.na(df$G_batting)] <- mean(df$G_batting, na.rm = TRUE)

来源:本地数据框 [20 x 3] 组:yearID、teamID

   yearID teamID G_batting
1    2004    SFN  11.00000
2    2006    CHN  43.00000
3    2007    CHA   2.00000
4    2008    BOS   5.00000
5    2009    SEA   3.00000
6    2010    SEA   4.00000
7    2012    NYA  **49.07894**

> mean(Batting$G_battin, na.rm = TRUE)
[1] **49.07894**

事实上,它估算的是整体平均值,而不是组平均值。您将如何在 dplyr 链中执行此操作?transform从基础 R使用也不起作用,因为它估算的是整体平均值而不是组平均值。这种方法也将数据转换为常规数据。一个框架。有一个更好的方法吗?

df %.% 
  group_by( yearID ) %.%
  transform(G_batting = ifelse(is.na(G_batting), 
    mean(G_batting, na.rm = TRUE), 
    G_batting)
  )

编辑:替换transformmutate给出以下错误

Error in mutate_impl(.data, named_dots(...), environment()) : 
  INTEGER() can only be applied to a 'integer', not a 'double'

编辑:添加 as.integer 似乎可以解决错误并产生预期的结果。另请参阅@eddi 的回答。

df %.% 
  group_by( teamID ) %.%
  mutate(G_batting = ifelse(is.na(G_batting), as.integer(mean(G_batting, na.rm = TRUE)), G_batting))

Source: local data frame [96,600 x 3]
Groups: teamID

   yearID teamID G_batting
1    2004    SFN        11
2    2006    CHN        43
3    2007    CHA         2
4    2008    BOS         5
5    2009    SEA         3
6    2010    SEA         4
7    2012    NYA        47

> mean_NYA <- mean(filter(df, teamID == "NYA")$G_batting, na.rm = TRUE)
> as.integer(mean_NYA)
[1] 47

编辑:跟进@Romain 的评论,我从 github 安装了 dplyr:

> head(df,10)
   yearID teamID G_batting
1    2004    SFN        11
2    2006    CHN        43
3    2007    CHA         2
4    2008    BOS         5
5    2009    SEA         3
6    2010    SEA         4
7    2012    NYA        NA
8    1954    ML1       122
9    1955    ML1       153
10   1956    ML1       153

> df %.% 
+   group_by(teamID)  %.%
+   mutate(G_batting = ifelse(is.na(G_batting), mean(G_batting, na.rm = TRUE), G_batting))
Source: local data frame [96,600 x 3]
Groups: teamID

   yearID teamID  G_batting
1    2004    SFN          0
2    2006    CHN          0
3    2007    CHA          0
4    2008    BOS          0
5    2009    SEA          0
6    2010    SEA 1074266112
7    2012    NYA   90693125
8    1954    ML1        122
9    1955    ML1        153
10   1956    ML1        153
..    ...    ...        ...

所以我没有得到错误(好),但我得到了一个(看似)奇怪的结果。

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1 回答 1

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您遇到的主要问题是当列是整数mean时返回双精度。G_batting因此,将平均值包含在as.integer其中会起作用,或者您需要将整个列转换为numeric我猜的。

也就是说,这里有几个data.table替代方案 - 我没有检查哪个更快。

library(data.table)

# using ifelse
dt = data.table(a = 1:2, b = c(1,2,NA,NA,3,4,5,6,7,8))
dt[, b := ifelse(is.na(b), mean(b, na.rm = T), b), by = a]

# using a temporary column
dt = data.table(a = 1:2, b = c(1,2,NA,NA,3,4,5,6,7,8))
dt[, b.mean := mean(b, na.rm = T), by = a][is.na(b), b := b.mean][, b.mean := NULL]

这就是我想要做的理想情况(有一个关于这个的FR):

# again, atm this is pure fantasy and will not work
dt[, b[is.na(b)] := mean(b, na.rm = T), by = a]

dplyr版本ifelse是(如在 OP 中):

dt %>% group_by(a) %>% mutate(b = ifelse(is.na(b), mean(b, na.rm = T), b))

我不确定如何data.tabledplyr. 我也不确定如何停止dplyr对数据进行加扰/排序(除了创建索引列)。

于 2014-02-12T00:25:07.707 回答