imagej - 从命令行运行斐济 jython 脚本

Question

我将斐济用于医学成像目的。我编写了一个 jython 脚本，并希望在 Windows 7 中从命令提示符运行相同的脚本。我尝试了不同的方式来运行脚本，但无法这样做。有人请帮助实现期望的目标。

Answer 1

有两种方法可以使用 Fiji 运行脚本。

糟糕的方式

打开控制台并将工作目录更改为 Fiji 文件夹。该文件夹应包含 ImageJ 二进制文件（例如 ImageJ-win64.exe）、jar、插件等。运行类似

cd c:\Fiji.app

运行 ImageJ。ImageJ-win64.exe - 在我的发行版中只是二进制名称。它可能会有所不同。

ImageJ-win64.exe --headless --jython my_script.py

您也可以在那里阅读斐济帮助，只需运行ImageJ-win64.exe --help

合适的方式

将 Fiji 文件夹 (c:\Fiji.app) 添加到PATH 变量并从任何目录运行脚本。

Answer 2

请参阅斐济 wiki 上的以无头模式运行脚本。

如果您仍然遇到问题，请提供更多信息，说明您尝试过的方法以及出了什么问题；请参阅如何提出一个好问题？详情。