我需要使用 blat 工具。我需要找到基因组中某些基因的起始和结束位置。我从以下链接下载了该工具： http : //genome.ucsc.edu/FAQ/FAQblat.html，一个 blat 文件 + blatSrc.zip 文件。我不知道如何运行它。用户指南可在以下链接中找到： http ://genome.ucsc.edu/goldenPath/help/blatSpec.html
谁能告诉我我必须写哪个命令才能得到我的结果？
谢谢。
问问题
149 次
1 回答
3
基本命令是：blat database query output.psl
例如，如果您想在人类基因组中搜索特定序列，您的命令可能是：blat hg19.fa query_sequence.fa output.psl
在此处查看更多详细信息： http ://genome.ucsc.edu/goldenPath/help/blatSpec.html
于 2014-02-05T04:54:29.943 回答