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可以对 adplyr执行链式summarise操作data.frame吗?

我的 data.frame 具有以下结构:

data_df = tbl_df(data)    
data_df %.%
        group_by(col_1) %.%
        summarise(number_of= length(col_2)) %.%
        summarise(sum_of = sum(col_3)) 

这会导致 RStudio 遇到一条fatal error - R Session Aborted消息

通常plyr我会summarise毫无问题地包含这些功能。

更新

数据在这里。

代码是:

library(dplyr)

orth <- read.csv('orth0106.csv')
orth_df = tbl_df(orth)


orth_df %.%
    group_by(Hospital) %.%
    summarise(Procs = length(Procedure)) %.%
    summarise(SSIs = sum(SSI))
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1 回答 1

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我可以在运行 RStudio 0.97.551 的 Windows 7 机器上重现该错误

这可能是因为您正在调用summarise并链接到不存在的东西。您可以summarise像我在这里所做的那样使用 2 个不同的列。

url <- "https://raw.github.com/johnmarquess/some.data/master/orth0106.csv"

library(dplyr)

orth <- read.csv(url)
orth_df <- tbl_df(orth)


orth_df %.%
    group_by(Hospital) %.%
    summarise(Procs = length(Procedure), SSIs = sum(SSI))

## Source: local data frame [18 x 3]
## 
##    Hospital Procs SSIs
## 1         A   865   80
## 2         B  1069   38
## 3         C   796   24
## 4         D   891   35
## 5         E   997   39
## 6         F   550   30
## 7         G  2598  128
## 8         H   373   27
## 9         I  1079   70
## 10        J   714   30
## 11        K   477   30
## 12        L   227    2
## 13        M   125    6
## 14        N   589   38
## 15        O   292    3
## 16        P   149    9
## 17        Q  1984   52
## 18        R   351   13

无论如何,这看起来像是一个 RStudio 或一个dplyr错误。我会向哈德利提出一个问题,因为他可能关心任何一种方式。 https://github.com/hadley/dplyr/issues

编辑这(您的第一次通话)也会导致 rgui(Windows)和终端在以下情况下崩溃:

R version 3.0.2 (2013-09-25)
Platform: i386-w64-mingw32/i386 (32-bit)

这表明dplyrHadley 和 Romain 想知道一个问题。

为了得到我的第一点,我们运行:

orth_df %.%
    group_by(Hospital) %.%
    summarise(Procs = length(Procedure))

Source: local data frame [18 x 2]

   Hospital Procs
1         A   865
2         B  1069
3         C   796
4         D   891
5         E   997
6         F   550
7         G  2598
8         H   373
9         I  1079
10        J   714
11        K   477
12        L   227
13        M   125
14        N   589
15        O   292
16        P   149
17        Q  1984
18        R   351

应该去哪里%.% summarise(SSIs = sum(SSI))SSI

所以你认为正在发生的链接失败了。以我的理解与工作原理%.%并不完全一样,ggplot2但相似。一旦您在ggplot2初始映射中传递数据,您就可以稍后访问它。这里 %.% 似乎修改了抓取左边的块并像这样对其进行操作:

在此处输入图像描述

所以你抓住了:

   Hospital Procs
1         A   865
2         B  1069
3         C   796
.
.
.
17        Q  1984
18        R   351

当你使用时%.% summarise(SSIs = sum(SSI)),没有SSI得到。所以想到的类比是串行与并行布线圣诞灯%.% = serial ggplot() + = parallel. 这是非程序员对事物的理解,R 大师可能会来告诉我我很愚蠢,但现在这是你所拥有的最好的理论。

于 2014-01-25T08:23:18.017 回答