3

当时间戳不唯一时,在 Pandas DataFrame 中按日期计算观察值的最佳方法是什么?

df = pd.DataFrame({'User' : ['A', 'B', 'C'] * 40,
                   'Value' : np.random.randn(120),
                   'Time' : [np.random.choice(pd.date_range(datetime.datetime(2013,1,1,0,0,0),datetime.datetime(2013,1,3,0,0,0),freq='H')) for i in range(120)]})

理想情况下,输出将提供每天的观察次数(或其他更高阶的时间单位)。然后可以使用它来绘制一段时间内的活动。

2013-01-01     60
2013-01-02     60
4

3 回答 3

3

这样做的“un-Panda-ic”方法是在转换为日期的日期时间系列上使用 Counter 对象,将此计数器转换回系列,并将该系列上的索引强制为日期时间。

In[1]:  from collections import Counter
In[2]:  counted_dates = Counter(df['Time'].apply(lambda x: x.date()))
In[3]:  counted_series = pd.Series(counted_dates)
In[4]:  counted_series.index = pd.to_datetime(counted_series.index)
In[5]:  counted_series
Out[5]:
2013-01-01     60
2013-01-02     60

一种更“熊猫-ic”的方式是对系列使用 groupby 操作,然后按长度聚合输出。

In[1]:  grouped_dates = df.groupby(df['Time'].apply(lambda x : x.date()))
In[2]:  grouped_dates['Time'].aggregate(len)
Out[2]:  
2013-01-01     60
2013-01-02     60

编辑:从这里借来的另一个非常简洁的可能性是使用nunique类:

In[1]:  df.groupby(df['Time'].apply(lambda x : x.date())).agg({'Time':pd.Series.nunique})
Out[1]:  
2013-01-01     60
2013-01-02     60

除了风格上的差异之外,一种是否比另一种具有显着的性能优势?还有其他我忽略的内置方法吗?

于 2014-01-24T22:08:58.503 回答
3

编辑:另一个更快的解决方案使用value_counts(和normalize):

In [41]: %timeit df1 = df.set_index('Time'); pd.value_counts(df1.index.normalize(), sort=False)
1000 loops, best of 3: 586 µs per loop

resample我原以为如果你使用 DatetimeIndex的话,这更简洁地写成:
但是它似乎要慢得多,而且(令人惊讶的是)Counter 解决方案是最快的

In [11]: df1 = df.set_index('Time')

In [12]: df1.User.resample('D', how=len)
Out[12]: 
Time
2013-01-01    59
2013-01-02    58
2013-01-03     3
Freq: D, Name: User, dtype: int64

总是值得为这些检查一些时间:

In [21]: %timeit df1.User.resample('D', how=len)
1000 loops, best of 3: 720 µs per loop

不幸的是,set_index这使得这更加昂贵:

In [22]: %timeit df1 = df.set_index('Time'); df1.User.resample('D', how=len)
1000 loops, best of 3: 1.1 ms per loop

比较:

In [23]: %%timeit
   ....: grouped_dates = df.groupby(df['Time'].apply(lambda x : x.date()))
   ....: grouped_dates['Time'].aggregate(len)
   ....: 
1000 loops, best of 3: 788 µs per loop

In [24]: %%timeit
   ....: counted_dates = Counter(df['Time'].apply(lambda x: x.date()))
   ....: counted_series = pd.Series(counted_dates)
   ....: counted_series.index = pd.to_datetime(counted_series.index)
   ....: 
1000 loops, best of 3: 568 µs per loop

我曾怀疑对于更多的日期会有所不同......

In [31]: df = pd.DataFrame({'User' : ['A', 'B', 'C'] * 400,
                   'Value' : np.random.randn(1200),
                   'Time' : [np.random.choice(pd.date_range(datetime.datetime(1992,1,1,0,0,0),datetime.datetime(2014,1,1,0,0,0),freq='H')) for i in range(1200)]})

In [32]: %timeit df1 = df.set_index('Time'); df1.User.resample('D', how=len)
10 loops, best of 3: 28.7 ms per loop

In [33]: %%timeit                  
   ....: grouped_dates = df.groupby(df['Time'].apply(lambda x : x.date()))
   ....: grouped_dates['Time'].aggregate(len)
   ....: 
100 loops, best of 3: 6.82 ms per loop

In [34]: %%timeit                  
   ....: counted_dates = Counter(df['Time'].apply(lambda x: x.date()))
   ....: counted_series = pd.Series(counted_dates)
   ....: counted_series.index = pd.to_datetime(counted_series.index)
   ....: 
100 loops, best of 3: 3.04 ms per loop

但是计数器仍然赢了......!

编辑:但被value_counts粉碎:

In [42]: %timeit df1 = df.set_index('Time'); pd.value_counts(df1.index.normalize(), sort=False)
1000 loops, best of 3: 989 µs per loop
于 2014-01-24T22:44:30.733 回答
0

len(Series.unique()) 可能会更快。

在我的电脑上:

%timeit df1 = df.set_index('Time'); pd.value_counts(df1.index.normalize(), sort=False)
1000 loops, best of 3: 2.06 ms per loop

尽管

%timeit df1 = df.set_index('Time'); len(df1.index.normalize().unique())
1000 loops, best of 3: 1.04 ms per loop

有趣的是,len(Series.unique())通常比Series.nunique()快得多。对于具有多达 x000 个项目的小型阵列,它的速度要快 10-15 倍,对于具有数百万个项目的大型阵列,它的速度要快 3-4 倍。

于 2014-05-02T23:10:52.420 回答