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我想知道是否可以在函数中调用SQL函数R？

例如说我有这个虚拟数据和SQL函数Postgres 9.3

CREATE TABLE tbl (
   id VARCHAR(2) PRIMARY KEY
   ,name TEXT
   ,year_born NUMERIC
   ,nationality TEXT
);

INSERT INTO tbl(id, name, year_born, nationality)
VALUES ('A1','Bill',2001,'American')
      ,('B1','Anna',1997,'Swedish')
      ,('A2','Bill',1991,'American')
      ,('B2','Anna',2004,'Swedish')
      ,('B3','Anna',1989,'Swedish')
      ,('A3','Bill',1995,'American');


CREATE FUNCTION retrieve_data(TEXT) 
RETURNS TABLE ( id VARCHAR(2), name TEXT, year_born NUMERIC, nationality TEXT ) AS 
$func$
SELECT id, name, year_born, nationality
FROM tbl
WHERE name=$1 OR nationality=$1
GROUP BY 1
ORDER BY 1
$func$ LANGUAGE sql

我可以通过和包访问这些数据并在R环境中运行函数，如下所示；RPostgreSQLsqldf

require(RPostgreSQL)
require(sqldf)

options(sqldf.RPostgreSQL.user = "****", 
        sqldf.RPostgreSQL.password = "****",
        sqldf.RPostgreSQL.dbname = "test_db",
        sqldf.RPostgreSQL.host = "localhost", 
        sqldf.RPostgreSQL.port = 5432)

sqldf("select * from retrieve_data('Bill')")

SQL但是有没有办法在函数中调用上述R函数，例如；

myfunc <- function(name) {
sqldf("select * from retrieve_data(name)")
}

myfunc('Bill')

任何指针将不胜感激，谢谢！

更新

按照@G 的建议使用包中的$fn前缀。sqldf格洛腾迪克

myfunc2 <- function(name){
   fn$sqldf("select * from retrieve_data('$name')")
}

或将上面的代码交换为options下面的代码以匹配@dickoa 建议的答案

require(RPostgreSQL)
drv <- dbDriver("PostgreSQL")
con <- dbConnect(drv,
                 user="****",
                 password="****",
                 dbname="test_db",
                 host="localhost",
                 port=5432)
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1 回答 1

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诀窍是使用shQuote，sprintf但我确信有一些聪明的方法可以做到这一点。

library(sqldf)
library(RPostgreSQL)

options(sqldf.RPostgreSQL.user = "****",
        sqldf.RPostgreSQL.dbname = "****",
        sqldf.RPostgreSQL.host = "localhost",
        sqldf.RPostgreSQL.port = 5432)

myfunc <- function(name)
    sqldf(sprintf("select * from retrieve_data(%s)", shQuote(name)))

myfunc('Bill')
##   id name year_born nationality
## 1 A1 Bill      2001    American
## 2 A2 Bill      1991    American
## 3 A3 Bill      1995    American

如果你想避免引用字符串，那么你可以使用

drv <- dbDriver("PostgreSQL")
con <- dbConnect(drv, dbname = "tempdb")
myfunc2 <- function(name)
    dbGetQuery(con, "select * from retrieve_data($1)", name)

myfunc2("Bill")
##   id name year_born nationality
## 1 A1 Bill      2001    American
## 2 A2 Bill      1991    American
## 3 A3 Bill      1995    American
于 2014-01-23T19:23:02.640 回答