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我在集群上运行 matlab。当我从集群上的交互式 matlab 会话运行我的 .m 脚本时，我的结果是可重现的。但是，当我从 qsub 命令运行相同的脚本时，作为阵列作业的一部分，远离我的监视，我得到了可信但无法重现的结果。.m 文件的作用完全相同，包括将结果保存为 .mat 文件。

任何人都知道为什么以一种方式运行脚本给出可重现的结果，而以另一种方式运行它们变得不可重现？

这仅仅是重现性的问题还是表明结果不准确？

%%%%% 感谢 spuder 的帮助。以防万一有人偶然发现并感兴趣，这里有一些进一步的信息。如果您在 Matlab 作业中使用多个线程，这可能会导致从其他作业中窃取资源，从而对结果造成严重破坏。因此，您有 2 个选项： 1. 选择对节点的独占访问。我正在使用的集群当前不允许并行阵列作业，所以这样做对我来说非常浪费 - 我拿了一个整个节点但串行使用它。2. 让 matlab 在 singleCompThread 上运行。这可能会使您的脚本需要更长的时间才能完成，但它会更快地通过队列获取作业。

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有很多变数在起作用。排除网络性能和负载等瞬态问题，这里有几个可能的解释：

当您从使用 qsub 运行交互式作业时，您将获得不同批次的节点。

我已经看到一些站点将“独占”策略分配给运行交互式作业的节点，并将“共享”策略分配给运行排队的“qsub”作业的节点。如果是这种情况，那么您几乎总是会在独占节点上看到更好的性能。

另一个答案可能是交互式作业被分配给网络拥塞较少的节点。

此外，如果您请求多个节点，并且您碰巧落在遍历多个跃点的节点上，那么您可能会看到明显的网络速度下降。解决方案是让集群管理员设置节点集。

您是否使用多个节点来完成这项工作？你是如何请求资源的？

于 2013-12-28T04:24:36.280 回答