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更新接近。现在我正在运行应该生成模块f2py的文件。.pyf_glmnet

我使用以下命令构建包python-glmnet数据包。

python setup.py config_fc --fcompiler=gnu95         
                                           --f77flags='-fdefault-real-8'         
                                          --f90flags='-fdefault-real-8' build

但是当我导入模块时，我得到了这个错误：

文件“/Users/rose/221/tagger/tagger/glmnet/glmnet.py”，第 2 行，在 import _glmnet ImportError: No module named _glmnet

如何导入该模块？

glmnet 目录还包含一个glmnet.pyf以以下内容开头的文件：

!    -*- f90 -*-
! Note: the context of this file is case sensitive.

python module _glmnet ! in
    interface  ! in :_glmnet
        subroutine elnet(ka,parm,no,ni,x,y,w,jd,vp,ne,nx,nlam,flmin,ulam,thr,isd,lmu,a0,ca,ia,nin,rsq,alm,nlp,jerr) ! in :glmnet:glmnet.f
            integer optional :: ka=1 ! Use covariance updates over naive by default
            real*8 :: parm
            integer intent(hide),check(shape(x,0)==no),depend(x) :: no=shape(x,0)
            integer intent(hide),check(shape(x,1)==ni),depend(x) :: ni=shape(x,1)
            real*8 dimension(no,ni) :: x
            real*8 dimension(no),depend(no) :: y
            real*8 dimension(no),depend(no) :: w
            integer dimension(*) :: jd
            real*8 dimension(ni),depend(ni) :: vp
            integer optional,depend(x) :: ne=min(shape(x,1), nx)
            integer :: nx
            integer optional,check((flmin < 1.0 || len(ulam)==nlam)),depend(flmin,ulam) :: nlam=len(ulam)
            real*8 :: flmin
            real*8 dimension(nlam) :: ulam
            real*8 :: thr
            integer optional :: isd=1 ! Standardize predictors by default

更新

我在哪里可以找到这个_glmnet模块？是否包含在 glmnet.pyf 文件中，如下图所示？我尝试将此 glment 文件夹添加到我的PYTHONPATH.，但这并没有改变任何东西。

~/221/tagger/tagger/glmnet master ls
__init__.py                  example_lasso_elastic_net.py glmnet.pyc
__init__.pyc                 glmnet.f                     glmnet.pyf
elastic_net.py               glmnet.py
~/221/tagger/tagger/glmnet master head -10 glmnet.pyf
!    -*- f90 -*-
! Note: the context of this file is case sensitive.

python module _glmnet ! in
    interface  ! in :_glmnet
        subroutine elnet(ka,parm,no,ni,x,y,w,jd,vp,ne,nx,nlam,flmin,ulam,thr,isd,lmu,a0,ca,ia,nin,rsq,alm,nlp,jerr) ! in :glmnet:glmnet.f
            integer optional :: ka=1 ! Use covariance updates over naive by default
            real*8 :: parm
            integer intent(hide),check(shape(x,0)==no),depend(x) :: no=shape(x,0)
            integer intent(hide),check(shape(x,1)==ni),depend(x) :: ni=shape(x,1)
~/221/tagger/tagger/glmnet master echo $PYTHONPATH
/Users/rose/221/tagger/tagger/glmnet:
~/221/tagger/tagger/glmnet master cd ..
~/221/tagger/tagger master python main.py
Traceback (most recent call last):
  File "main.py", line 14, in <module>
    from glmnet import glmnet
  File "/Users/rose/221/tagger/tagger/glmnet/glmnet.py", line 2, in <module>
    import _glmnet
ImportError: No module named _glmnet
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据我所知，它正在寻找_gmlnet模块，该模块在gmlnet.pyf. gmlnet.pyf不是 python 模块，它是一个名为 的程序的一组附加指令f2py，python 将忽略该.pyf文件。您需要.pyf使用f2py. 使用这样的命令：

f2py -c --fcompiler=gnu95 gmlnet.pyf gmlnet.f

尝试安装f2py然后重新安装gmlnet包。

于 2013-12-10T23:49:30.443 回答
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在不了解其他情况的情况下，这看起来像 python 不知道_gmlnet包的位置。如果您还没有，请使用 . 检查PYTHONPATH环境变量的内容echo $PYTHONPATH。如果_gmlnet目录不存在，则需要添加它。

  • 要向PYTHONPATHin添加bash内容，请运行以下命令：

    export PYTHONPATH=/path/to/_gmlnet/directory:$PYTHONPATH

  • 您可以通过进入交互式终端并键入来检查 python 是否已正确解析

    import sys

    print sys.path

  • 最后，您可能不希望每次启动终端时都必须在 shell 中输入它。对于 Mac OS，~/.bash_profile如果您使用bash. 确保此文件以换行符结尾。

    export PYTHONPATH=/path/to/_gmlnet/directory:$PYTHONPATH

于 2013-12-10T22:42:06.170 回答