r - 内存限制opencpu / R

Question

我对opencpu有一个奇怪的问题。我正在设置一个 Web 接口以使用 xcms（R 包），并且在使用 Web 接口读取 mzxml 文件时出现错误：无法分配大小为 207.2 Mb 的向量。这看起来像是来自 R 的错误，但是如果我在服务器上打开 R 并尝试自己打开文件，它可以工作并且 R 创建和对象为 435Mb。是否在某个地方设置了内存限制（apache、opencpu、R）？如果我使用 ulimit -a 最大内存大小设置为无限制。

干杯，里科

Answer 1

是的，OpenCPU 云服务器使用RAppArmor包RLIMIT_AS对每个请求设置内存限制。这是为了防止单个用户消耗服务器上的所有资源。默认限制为每个进程 1GB。您可以通过编辑来配置这些限制：

/etc/opencpu/server.conf

编辑文件后，重新启动服务器：

sudo service opencpu restart

有关 rlimits 的更多信息，请阅读 RAppArmor 上的JSS 论文。