python - qsub 和 python，导入 .py 模块但为 .pyf 返回 ImportError

Question

我正在尝试通过提交作业qsub myScript.sh -cwd，其中 shell 脚本运行 Python-2.7 脚本，myPython.py.

    # myScript.sh
    python2.7 myPython.py

现在，myPython.py需要导入存储在我的本地目录中的 Python 包，以便脚本以

    # myPython.py
    import sys
    sys.path.append('/file/path/for/package')
    import package

提交作业后，日志文件包含 Python 的以下输出：

    ImportError: No module named problem_c

这个错误发生在从*.py文件中导入了几个模块而没有返回错误之后，所以我相当确定这不是路径的问题。我发现的唯一区别是problem_c文件以.pyf（即problem_c.pyf）结尾。它与以 . 结尾的模块存储在同一目录中.py。

当我在本地运行脚本python2.7 myPython.py时，加载包时不会发生此错误。但是，如果不将其提交到队列中，该作业的内存占用太大而无法完成。为什么在我使用时编写为.pyf文件的模块会受到不同的处理qsub，在这种情况下如何导入它们？

（如果重要的话，我正在处理的集群是使用 Sun Grid Engine 设置的。）

谢谢你的想法。

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或 f2py。显然您没有在集群上添加模块。

于 2013-11-21T21:52:29.403 回答

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以下是导入模块及其路径的方法：

import imp
module_name = imp.load_source('module_name', '/abs/path/to/module/module_name.py')

# usage
module_name.function()

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